膀胱癌Notch信号通路基因突变作为预后生物标志物的识别
该数据集包含膀胱癌患者的基因突变数据，主要聚焦于Notch信号通路相关基因（如NOTCH7、CNTN6、CREBBP等），通过分析癌症基因组图谱和验证集，结合免疫浸润、蛋白质相互作用网络和富集分析，旨在识别可作为免疫治疗预后生物标志物的基因突变，并探索潜在的药物靶点（如IRF1和B2M），用于预测膀胱癌患者对免疫治疗的反应和预后评估。
创建时间2025-01-16
更新时间2025-01-16
原始链接
https://figshare.com/articles/dataset/Identification_of_Notch_Signaling_Pathway_Gene_Mutations_as_a_Prognostic_Biomarker_for_Bladder_Cancer/28219645
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资源简介
该数据集旨在识别Notch信号通路基因突变作为膀胱癌的预后生物标志物。数据集基于癌症基因组图谱（TCGA）和验证集筛选关键Notch信号通路基因，并进行了免疫浸润、蛋白质-蛋白质相互作用网络、京都基因与基因组百科全书以及基因集富集分析。此外，还利用T细胞受体、B细胞受体和CERES评分筛选了潜在的免疫治疗药物靶点。研究发现NOTCH7基因突变在膀胱癌中与免疫浸润水平（主要与T细胞相关）存在显著差异，可作为免疫治疗的预后因子，而IRF1和B2M是NOTCH7突变的潜在药物靶点。结论表明，NOTCH7基因突变可作为膀胱癌免疫治疗的生物标志物，且研究识别出CNTN6、CREBBP、EP300、NCOR1、NCOR2、NOTCH2和SPEN等七个Notch信号通路相关基因可用于预测患者对免疫治疗的反应。
提供机构：Wang, XinHong; Xue, Chong; Chen, Xin; Lin, KaoXing; Tong, YunGuang
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