2026 MSK Tn-seq Workshop 示例数据集
该数据集用于基于Galaxy的Tn-seq数据分析动手培训，包括FASTQ处理、TA位点读段计数、TRANSIT分析和Circos可视化
基本信息
资源简介
2026 MSK Tn-seq Workshop 示例数据集
该数据集用于基于Galaxy的Tn-seq数据分析动手培训，包括FASTQ处理、TA位点读段计数、TRANSIT分析和Circos可视化
Example Dataset for the 2026 MSK Tn-seq Workshop.
【数据集背景】
源站首次发布：2026。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：2026 MSK Tn-seq Workshop的示例数据集。该数据集用于基于Galaxy的Tn-seq数据分析动手培训，包括FASTQ处理、TA位点读段计数、TRANSIT分析和Circos可视化。该数据集包含原始Tn-seq测序文件以及为2026 MSK Tn-seq Workshop动手分析准备的下采样示例文件。Example_*.fastq.gz文件是用于Galaxy工作坊练习的下采样数据集。原始测序文件（Untreated.fastq、Treated1.fastq和Treated2.fastq）也一并提供，供参考和扩展分析使用。工作坊使用的参考基因组和注释文件包含在Example_Reference.fasta和Example_Annotation.gff中。
【主题与分类】
主题标签：Tn-seq、膀胱癌、Galaxy分析、TRANSIT分析、Circos可视化、FASTQ处理、TA位点计数。本站分类：肿瘤/膀胱癌。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.23073648
使用许可：Creative Commons Attribution 4.0 International。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23073648
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 1.14 GB。
数据说明
2026年MSK Tn-seq研讨会示例数据集。本数据集用于基于Galaxy的Tn-seq数据分析实操培训，内容包括FASTQ处理、TA位点读段计数、TRANSIT分析以及Circos可视化。本数据集包含原始Tn-seq测序文件以及为2026年MSK Tn-seq研讨会实操分析准备的下采样示例文件。Example_*.fastq.gz文件为下采样数据集，用于基于Galaxy的研讨会练习。原始测序文件（Untreated.fastq、Treated1.fastq和Treated2.fastq）也一并提供，供参考和扩展分析使用。研讨会所用的参考基因组和注释文件以Example_Reference.fasta和Example_Annotation.gff形式包含在内。
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