人基底细胞癌单细胞空间转录组学数据集（6k-plex CosMx SMI）
该数据集是一个包含6075个基因表达谱和232,802个细胞空间位置信息的单细胞空间转录组学数据集，数据模态包括基因表达矩阵、细胞形态图像特征和临床元数据，主要应用于研究基底细胞癌的肿瘤微环境空间结构、细胞异质性分布、创伤反应机制以及细胞间相互作用网络等癌症生物学和空间组学方向。
创建时间2024-12-09
更新时间2025-02-24
资源简介
该数据集是基于6k-plex CosMx SMI（Bruker Nanostring）原位分析平台采集的人基底细胞癌（BCC）单细胞空间转录组学数据集。数据集以Seurat对象的.rds格式提供，包含6075个基因在232,802个细胞中的原位表达谱及丰富的元数据。数据来源于4名患者的肿瘤组织切片，涵盖不同临床条件（如基线活检、创伤后、远处未创伤区域），并包含详细的细胞类型注释、空间位置信息、形态学特征、实验条件标注及细胞间相互作用分析。该数据集主要用于研究基底细胞癌的肿瘤微环境、细胞异质性、空间组织结构以及创伤反应等生物学问题，为癌症空间生物学和精准医疗研究提供重要资源。
提供机构：Zenodo
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