联合HHI与IT治疗晚期基底细胞癌数据集
该数据集包含三名晚期基底细胞癌患者在接受索立德吉与西米普利单抗联合治疗前后的多模态数据,主要包括通过10x Visium平台生成的空间转录组计数矩阵、对应的H&E染色组织病理图像,以及通过CITE-Seq技术获得的蛋白质组数据,覆盖基线及治疗开始后2至26周多个时间点的活检样本,旨在支持晚期基底细胞癌联合治疗机制、空间多组学整合分析及治疗反应生物标志物的研究。
创建时间2025-12-04
更新时间2025-12-10
资源简介
该数据集包含在研究联合使用索立德吉(sonidegib)和西米普利单抗(cemiplimab)治疗晚期基底细胞癌项目过程中生成的已处理计数矩阵和H&E染色图像数据。数据来源于三名患者的样本(rqb506_Pat1, icf063_Pat2, ptw592_Pat3),通过10x Visium平台生成空间转录组数据,提供了经过spaceranger流程(v2.1.1)过滤的矩阵输出及对应的H&E图像文件(_spatial.zip)。除转录组外,还通过CITE-Seq技术检测了蛋白质组。每个样本板包含不同时间点的多个活检组织,基线数据为联合治疗开始前的采样,V3-13为治疗开始后2周至26周随访时的采样。此外,数据集还包含由Parse Biosciences公司的Trailmaker流程(两次独立运行)输出的已处理矩阵及相应的加载表(Trailmaker流程所需的元数据输入),已处理矩阵为Seurat对象格式。该数据集主要用于晚期基底细胞癌的联合治疗机制研究、空间多组学分析及生物标志物探索。
提供机构:Zenodo
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