COBRA数据工具包:用于计算皮肤病理学的基底细胞癌及多种皮肤恶性肿瘤全切片图像数据集

COBRA数据集是一个包含基底细胞癌及多种皮肤恶性肿瘤的全切片图像数据集,数据模态为高分辨率病理图像(金字塔TIFF格式,0.5微米/像素)及对应的文本报告和标注。它提供了切片级诊断标签、像素级分割标注、荷兰语病理报告和预计算的基础模型嵌入,主要用于支持计算皮肤病理学的研究,如皮肤癌的自动分类与分割、分布外检测以及视觉语言模型开发等人工智能应用。

Zenodo
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2026-05-18 更新
创建时间2026-05-18
更新时间2026-05-18
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https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.20266768

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资源简介

COBRA(Classification Of Basal cell carcinoma, Risky skin tumors and Abnormalities)是一个用于计算病理学研究的综合性皮肤病理学数据集。该数据集旨在满足大规模、高质量数据的需求,以训练和验证用于皮肤癌检测、报告生成和分布外检测的人工智能模型。数据集包含来自拉德堡德大学医学中心的全切片图像(WSI),涵盖多个诊断类别,包括基底细胞癌、良性及癌前病变、鳞状细胞癌、淋巴瘤、黑色素瘤、默克尔细胞癌、皮肤转移瘤和罕见附件肿瘤。关键特征包括多级标注(切片级诊断标签和切除标本的像素级标注)、荷兰语病理报告、预计算的PRISM基础模型嵌入、标准化图像格式(0.5微米/像素的金字塔TIFF)以及匿名患者元数据。数据集支持多种计算病理学任务,如皮肤病变的二元和多分类、组织分区的语义分割、临床安全中的分布外检测、结合病理报告的视觉语言模型开发以及使用基础模型嵌入的零样本分类。

提供机构:Zenodo

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影像COBRA data toolkit: A whole-slide image dataset of basal cell carcinoma and diverse skin malignancies for computational dermatopathology