人类B细胞转录调控网络
该数据集包含人类B细胞的转录调控网络和基因表达数据，数据模态包括基因表达谱和基因调控网络，主要基于264个样本（涵盖正常B细胞、B细胞淋巴瘤和细胞系）通过ARACNe算法逆向构建，用于研究B细胞在生理和病理状态下的转录调控机制，为淋巴瘤等疾病的分子机制解析和靶点发现提供重要资源。
创建时间2013-05-21
更新时间2013-05-21
原始链接
https://figshare.com/articles/dataset/Human_B_cell_transcriptional_regulatory_network/680888
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资源简介
该数据集是一个人类B细胞转录调控网络，通过ARACNe算法（PMID 16723010）从264个样本中逆向构建而成。样本包括正常B细胞（初始和生发中心B细胞）、多种肿瘤表型（B细胞淋巴瘤）以及细胞系。基因表达数据使用Affymetrix H-GU133Plus2芯片平台进行检测，经过cleaner算法（PMID 20042104）处理，并通过Bioconductor的affy包中的MAS5方法进行标准化。数据集包含两个主要部分：调控网络（包含1,223个转录因子调控13,007个靶基因的327,837个相互作用）以及用于构建该网络的基因表达数据集（包含264个样本×13,007个探针集）。该数据主要用于研究B细胞在正常和肿瘤状态下的转录调控机制，为淋巴瘤等疾病的分子机制研究和潜在治疗靶点发现提供支持。
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