Fab5F6结合态下GluN1-2A NMDAR的冷冻电镜结构
该数据集包含人源抗体Fab5F6与GluN1-2A NMDA受体结合状态的冷冻电镜结构数据，涉及蛋白质三维坐标、电子密度图及糖配体等结构模态，主要用于研究自身免疫性脑炎中抗体介导的NMDA受体聚集和内吞机制，为疾病病理机制解析提供关键结构信息。
基本信息
资源简介
Fab5F6结合态下GluN1-2A NMDAR的冷冻电镜结构
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Cryo-EM structure of GluN1-2A NMDAR in complex with human Fab5F6 in one fab bind conformation》。
【数据内容】
源站原始描述：NMDAR, autoimmune encephalitis, MEMBRANE PROTEIN
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI：10.1038/s41594-024-01387-3。
【主题与分类】
主题标签：MEMBRANE PROTEIN。
【获取与许可】
源站页面：https://www.rcsb.org/structure/8JJ0
规范引用：Structural basis for antibody-mediated NMDA receptor clustering and endocytosis in autoimmune encephalitis. (2024) Nat.Struct.Mol.Biol
下载信息
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数据集获取
源站：https://pdbj.org/mine/summary/8jj0
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个结构生物学数据集，提供了人源抗体Fab5F6与GluN1-2A亚基组成的NMDA受体（NMDAR）结合时的冷冻电镜结构，分辨率约为4.5埃。数据内容包括蛋白质三维坐标、电子密度图以及相关配体（如N-乙酰葡糖胺等糖分子）的结构信息。该结构通过冷冻电镜技术解析，来源于Protein Data Bank Japan（PDBj）数据库，主要研究抗体介导的NMDA受体聚集和内吞机制，为理解自身免疫性脑炎的病理机制提供了结构基础。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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