12例原发/复发IDH突变星形细胞瘤样本的NanoString GeoMx DSP数据集

该数据集包含6名IDH突变星形细胞瘤患者的12对配对肿瘤样本的空间转录组数据,采用NanoString GeoMx数字空间分析技术测量约1800个基因在72个感兴趣区域的RNA表达水平,并提供了相应的组织图像。数据模态包括基因表达矩阵和病理图像,主要用于研究IDH突变星形细胞瘤的分子异质性、复发机制及空间转录组特征,支持神经胶质瘤分子病理学和空间转录组学领域的研究。

Zenodo
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2024-10-10 更新
神经胶质瘤分子病理空间转录组学
创建时间2023-01-05
更新时间2024-10-10
原始链接

https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.7348325

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资源简介

该数据集包含来自6名IDH突变星形细胞瘤患者的12对配对肿瘤切除样本的NanoString GeoMx数字空间分析仪数据。所有样本均携带IDH-R132H突变,首次切除样本为WHO 2016分级II级或III级,二次切除样本为WHO 2016分级IV级。通过NanoString癌症转录组图谱面板,测量了72个感兴趣区域中约1800个基因的RNA表达水平。数据集还提供了研究中使用的所有感兴趣区域的图像,按肿瘤对分组。该数据集可用于研究IDH突变星形细胞瘤的分子异质性、复发机制以及空间转录组学特征,主要应用于神经胶质瘤分子病理学和空间转录组学领域。

提供机构:Zenodo

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影像NanoString GeoMx DSP dataset from 12 primary/recurrent IDH-mutant astrocytoma samples