PXD000664：HL-60细胞上galectin-8新型多聚N-乙酰乳糖胺反受体Basigin的鉴定

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PXD000664：HL-60细胞上galectin-8新型多聚N-乙酰乳糖胺反受体Basigin的鉴定

PXD000664 数据集聚焦于急性髓系白血病相关的 HL-60 细胞，旨在鉴定 galectin-8 在该细胞表面的新型反受体。研究采用 gal-8 C 端单一糖识别结构域或全长 gal-8，对 HL-60 细胞膜制备物进行亲和层析，并结合蛋白质组学方法，以分离和鉴定 galectin-8 的推定配体。通过这一策略，研究识别出新型多聚 N-乙酰乳糖胺反受体 Basigin。该数据集属于肿瘤 / 急性髓系白血病分类，来源于 ebi.ac.uk，主题标签涵盖受体、液相色谱-串联质谱、白血病、HL-60、galectin-8，以及急性白血病和人类物种的受控词表标识。整体而言，该数据集为理解 galectin-8 在急性髓系白血病细胞中的相互作用提供了蛋白质组学层面的信息。

【数据集背景】

急性髓系白血病是一种影响髓系造血细胞的恶性疾病，HL-60 细胞是研究中常用的急性髓系白血病细胞模型。Galectin-8 是一种能够识别特定糖结构的蛋白质，其在细胞表面的反受体鉴定对于理解相关生物学过程具有重要意义。该数据集所对应的研究正是围绕这一背景展开，试图在 HL-60 细胞膜制备物中寻找 galectin-8 的推定配体，并最终识别出新型多聚 N-乙酰乳糖胺反受体 Basigin。这一工作有助于拓展对急性髓系白血病细胞表面糖-蛋白相互作用的认识。

【数据内容】

该数据集的内容涉及利用亲和层析结合蛋白质组学方法所获得的鉴定结果。具体而言，研究使用了 gal-8 C 端单一糖识别结构域或全长 gal-8 作为诱饵，对 HL-60 细胞膜制备物进行亲和层析，随后通过蛋白质组学手段分离和鉴定 galectin-8 的推定配体。最终识别出的关键分子为新型多聚 N-乙酰乳糖胺反受体 Basigin。数据集的主题标签包括受体、液相色谱-串联质谱、白血病、HL-60、galectin-8，以及急性白血病和人类物种的受控词表标识。除上述信息外，源站未提供更详细的数据内容描述。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk。根据源站描述，研究采用 gal-8 C 端单一糖识别结构域或全长 gal-8，对 HL-60 细胞膜制备物进行亲和层析，并结合蛋白质组学方法，以分离和鉴定推定配体。数据集的分类为肿瘤 / 急性髓系白血病，主题标签中包含了与实验方法、细胞模型、蛋白质和疾病相关的术语。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息以及实验操作的详细步骤，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与急性髓系白血病相关的蛋白质组学研究，尤其是涉及 galectin-8 配体鉴定、HL-60 细胞膜蛋白相互作用分析、以及多聚 N-乙酰乳糖胺反受体 Basigin 的探索性研究。主题标签中的液相色谱-串联质谱表明该数据集可能涉及基于质谱的蛋白质鉴定方法，因此也可用于方法学参考或与其他蛋白质组学数据集进行比较分析。此外，由于涉及受体和白血病相关标签，该数据集可能对研究细胞表面糖识别机制的人员具有参考价值。关于具体的适用分析类型或下游应用，源站未提供更多说明。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 获取。使用者可根据数据集标识 PXD000664 进行检索和访问。由于数据集涉及蛋白质组学鉴定结果，使用者可能需要具备一定的蛋白质组学数据处理能力，以便对鉴定出的配体信息进行进一步分析。关于数据文件的具体格式、下载方式、是否需要专用软件或分析流程，源站未提供。因此，建议使用者直接访问来源站获取最新和详细的使用说明。

【质量与限制】

该数据集基于亲和层析和蛋白质组学方法，旨在鉴定 galectin-8 在 HL-60 细胞膜制备物中的推定配体，并识别出 Basigin 作为新型多聚 N-乙酰乳糖胺反受体。然而，关于数据集的覆盖率、重复性、假阳性控制、定量准确性等质量指标，源站未提供。此外，该数据集仅涉及 HL-60 细胞模型，其结果能否推广至其他急性髓系白血病细胞或临床样本尚不明确。关于数据的具体限制和注意事项，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk，标识为 PXD000664。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许商业用途等信息，源站未提供。使用者在使用该数据集时，应自行查阅来源站的相关页面以获取准确的引用和许可信息。