急性髓系白血病原癌基因与抑癌基因启动子序列中胞嘧啶与CpG岛密度检测

该数据集包含急性髓系白血病的原癌基因、抑癌基因及对照基因的启动子序列数据,通过分析这些序列中胞嘧啶重复序列和CpG岛的密度分布,揭示了甲基化潜在位点与转录起始位点的关联,主要用于癌症表观遗传学和白血病分子机制的研究。

Mendeley Data
2024-06-25 更新
急性髓系白血病基因甲基化
创建时间2023-06-28
更新时间2024-06-25
原始链接

https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Detection_of_cytosine_and_CpG_density_in_proto-oncogenes_and_tumor_suppressor_genes_in_promoter_sequences_of_acute_myeloid_leukemia/4772305/1

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资源简介

该数据集聚焦于急性髓系白血病(AML)中启动子序列的甲基化研究。数据包含25个原癌基因、抑癌基因及对照基因的启动子序列,通过分析这些序列在特定核苷酸窗口(如-500至+100的100个核苷酸窗口和-100至+100的20个核苷酸窗口)中的胞嘧啶重复序列密度(包括CC、CCC等重复模式)和CpG岛密度,以探究其与AML发病机制的关系。数据来源于对启动子序列的生物信息学分析,旨在揭示甲基化潜在位点的分布规律,特别是靠近转录起始位点(TSS)区域的密度变化。该数据集主要用于癌症基因组学、表观遗传学及白血病分子机制的研究,为理解启动子甲基化在肿瘤发生中的作用提供数据支持。

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影像Detection of cytosine and CpG density in proto-oncogenes and tumor suppressor genes in promoter sequences of acute myeloid leukemia