S5 文件：急性髓系白血病骨髓来源细胞外囊泡miRNA数据集
该数据集来自急性髓系白血病（AML）患者骨髓穿刺液，通过尺寸排阻色谱分离细胞外囊泡（EV），共鉴定出965个EV来源的miRNA
基本信息
资源简介
S5 文件：急性髓系白血病骨髓来源细胞外囊泡miRNA数据集
S5 File -
该数据集来自急性髓系白血病（AML）患者骨髓穿刺液，通过尺寸排阻色谱分离细胞外囊泡（EV），共鉴定出965个EV来源的miRNA。研究纳入32例初诊AML患者，按风险分层分为有利组（n=10）与非有利组（n=22），在非有利组中鉴定出32个差异表达的EV来源miRNA，并结合The Cancer Genome Atlas的AML患者信息分析这些miRNA与风险分层及患者生存的相关性。数据可用于AML风险分层相关的miRNA表达分析及生存预测研究（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2024-08-23。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：目的 本研究旨在利用急性髓系白血病（AML）患者骨髓穿刺液中的细胞外囊泡（EV）建立具有临床意义的microRNA（miRNA）集合，并鉴定在AML中与这些EV来源miRNA相互作用的基因。材料与方法 在AML诊断时从32例AML患者采集骨髓穿刺液。使用尺寸排阻色谱法分离EV。在所有样本中共鉴定出965个EV来源的miRNA。结果 我们分析了有利风险组（n=10）与非有利风险组（n=22）中这些EV来源miRNA的表达水平；在非有利风险组中鉴定出32个差异表达的EV来源miRNA。利用来自The Cancer Genome Atla的AML患者信息，分析了这些miRNA与风险分层及患者生存的相关性。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 107.65 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0306962.s009。
【主题与分类】
源站学科分类：Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签：cancer genome atlas、acute myeloid leukemia、acute myelogenous leukemia、short overall survival、isolated using size、identified 21 mrnas、favorable risk group、patient survival、risk stratification、risk groups。本站分类：肿瘤/急性髓系白血病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/S5_File_-/26821940
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Kang, Ka-Won; Gim, Jeong-An; Hong, Sunghoi; Kim, Hyun Koo; Choi, Yeonho; Park, Ji-ho; et al. (2024). S5 File -. PLOS ONE. Dataset
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：S5 File -
- DOI：10.1371/journal.pone.0306962.s009
- 发布日期：2024-08-23
- 文件数：1 个
- 文件总体积：107.65 KB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/S5_File_-/26821940
命令行下载
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文件清单
pone.0306962.s009.xlsx（107.65 KB）
文件总体积 107.65 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
目的
本研究旨在利用急性髓系白血病（AML）患者骨髓（BM）抽吸物中的细胞外囊泡（EVs）建立具有临床意义的microRNA（miRNA）集，并鉴定在AML中与这些EV衍生miRNA相互作用的基因。材料与方法
在AML诊断时，从32例AML患者中收集了BM抽吸物。使用尺寸排阻色谱法分离EVs。在所有样本中共鉴定出965种EV衍生miRNA。结果
我们分析了有利风险组（n = 10）和非有利风险组（n = 22）中这些EV衍生miRNA的表达水平；在非有利风险组中鉴定出32种差异表达的EV衍生miRNA。利用来自癌症基因组图谱（TCGA）数据库的AML患者信息，分析了这些miRNA与风险分层及患者生存的相关性。在非有利风险组中表达下调的miRNA中，hsa-miR-181b和hsa-miR-143与非有利风险和较短的总生存期相关。
关于在非有利风险组中表达上调的miRNAs，hsa-miR-188和hsa-miR-501与非有利风险相关，并能预测较差的生存率。通过使用TCGA数据库对EV衍生的miRNAs-mRNA网络进行分析，我们识别出21个可能作为不良预后生物标志物的mRNAs。结论
总体而言，我们的研究结果表明，EV衍生的miRNAs可作为AML风险分层和预后的生物标志物。此外，这些基于EV衍生miRNA的生物信息学分析有助于高效识别具有生物标志物潜力的mRNAs，类似于先前基于细胞的方法。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0306962.s009（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/S5_File_-/26821940）。
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