全血转录组图谱可区分慢性下背痛易感性
数据涉及全血转录组图谱，用于比较下背痛发作后 6 周内疼痛消失的急性患者与 6 个月时发展为慢性下背痛的患者，以及发作时慢性下背痛患者与无痛健康对照的转录组差异
基本信息
资源简介
全血转录组图谱可区分慢性下背痛易感性
Whole blood transcriptomic profiles can differentiate vulnerability to chronic low back pain
该数据集来自 plos.figshare.com，包含 4 个文件，配套论文发表于 PLOS ONE（2019 年）。数据涉及全血转录组图谱，用于比较下背痛发作后 6 周内疼痛消失的急性患者与 6 个月时发展为慢性下背痛的患者，以及发作时慢性下背痛患者与无痛健康对照的转录组差异。差异表达基因以蛋白编码为主，慢性下背痛转录组富集已知疼痛基因、细胞外基质基因及扩展的主要组织相容性复合体基因。该数据可用于研究急性向慢性疼痛转化的分子机制及慢性下背痛的转录组特征（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Whole blood transcriptomic profiles can differentiate vulnerability to chronic low back pain》发表于 PLOS ONE（2019），DOI：10.1371/journal.pone.0216539。源站首次发布：2019-05-16。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：从急性疼痛向慢性疼痛转化的机制仍不清楚。在此，我们试图表征与慢性下背痛相关的转录组以及从急性下背痛向慢性下背痛转化的转录组。分析中，我们比较了以下全血转录组：(a) 下背痛发作后 6 周内不再有疼痛的患者（急性）与 6 个月时发展为慢性下背痛的患者（慢性 T5）；以及 (b) 下背痛发作时（慢性 T1）在 6 个月时发展为慢性疼痛的患者与健康无痛（正常）对照。大多数差异表达基因是蛋白编码基因。我们展示了一个独特的慢性下背痛转录组，其特征是已知疼痛基因、细胞外基质基因以及扩展的主要组织相容性复合体基因的显著富集。
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个，合计 1.09 MB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0216539。
【主题与分类】
源站学科分类：Microbiology、Cell Biology、Genetics、Physiology、Biotechnology、Environmental Sciences not elsewhere classified。主题标签：6 months、Whole blood transcriptomic profiles、antigen presentation pathway、MHC、II、transcriptome、extracellular matrix genes。本站分类：肌肉骨骼疾病/其他。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Microbiology、Cell Biology、Genetics、Physiology、Biotechnology、Environmental Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Whole_blood_transcriptomic_profiles_can_differentiate_vulnerability_to_chronic_low_back_pain/8140547
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：G. Dorsey, Susan; L. Renn, Cynthia; Griffioen, Mari; Lassiter, Cameron B.; Zhu, Shijun; Huot-Creasy, Heather; et al. (2019). Whole blood transcriptomic profiles can differentiate vulnerability to chronic low back pain. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Whole blood transcriptomic profiles can differentiate vulnerability to chronic low back pain
- DOI：10.1371/journal.pone.0216539
- 发布日期：2019-05-16
- 文件数：4 个
- 文件总体积：1.09 MB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Whole_blood_transcriptomic_profiles_can_differentiate_vulnerability_to_chronic_low_back_pain/8140547
命令行下载
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文件清单
pone.0216539.s001.docx（30.26 KB）pone.0216539.s002.txt（937.80 KB）pone.0216539.s003.docx（14.08 KB）pone.0216539.s004.tiff（109.94 KB）
文件总体积 1.09 MB（源站 API 实测）。
数据说明
从急性疼痛向慢性疼痛转变的机制仍不清楚。在此，我们试图刻画与慢性下背痛相关的转录组，以及与从急性下背痛向慢性下背痛转变相关的转录组。在分析中，我们比较了以下人群的全血转录组：(a) 下背痛发作时、发作后6周内不再有疼痛的患者（急性）与6个月时发展为慢性下背痛的患者（慢性T5）；以及 (b) 下背痛发作时（慢性T1）在6个月时发展为慢性疼痛的患者与无疼痛的健康（正常）对照。大多数差异表达基因是蛋白质编码基因。我们展示了一个独特的慢性下背痛转录组，其特征是已知疼痛基因、细胞外基质基因以及扩展的主要组织相容性复合体（MHC）基因组位点基因的显著富集。
从急性向慢性腰痛过渡的转录组特征表现为抗原呈递通路（MHC I类和II类）基因的显著上调，以及与氧化磷酸化相关的线粒体基因的下调，提示存在一种独特的腰痛慢性化易感性基因组特征。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0216539（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Whole_blood_transcriptomic_profiles_can_differentiate_vulnerability_to_chronic_low_back_pain/8140547）。
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