SAPHO患者循环外泌体miRNA高通量测序图谱

该数据集来自NCBI,对SAPHO综合征患者外周血外泌体miRNA进行高通量测序,分析其表达谱。SAPHO综合征以骨和皮肤的自身炎症性病变为特征,临床表现多样且病因不明,诊断和治疗受限

sra
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基因组回归Transcriptome or Gene expression
PRJNA934144: Profiles of circulating exosomal miRNA in SAPHO patients by high-throughput sequencing

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

SAPHO患者循环外泌体miRNA高通量测序图谱

PRJNA934144 数据集来自 NCBI,主题为转录组或基因表达,聚焦于 SAPHO 综合征患者外周血外泌体 miRNA 的高通量测序表达谱。SAPHO 综合征是一种以骨和皮肤自身炎症性病变为特征的罕见疾病,临床表现多样、病因认识不足,诊断与治疗均受到限制。该研究通过对外周血外泌体 miRNA 进行表达谱分析,旨在识别与该疾病相关的关键 miRNA,并探索可作为 SAPHO 综合征潜在生物标志物的新分子。数据集在本站归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他。

【数据集背景】

SAPHO 综合征即滑膜炎、痤疮、脓疱病、骨肥厚和骨炎综合征,是一种以骨和皮肤自身炎症性病变为特征的罕见疾病。该病临床表现多样,且对其病因的认识尚不充分,限制了诊断和治疗。SAPHO 综合征也被归类为原发性炎症性骨炎。该病的骨关节受累通常起病隐匿,相关的生物标志物可能对诊断、治疗以及阐明 SAPHO 的发病机制具有重要意义。基于这一背景,研究者对外周血中的外泌体 miRNA 表达进行谱分析,以期识别与疾病相关的关键 miRNA,并尝试寻找可作为 SAPHO 综合征潜在生物标志物的新分子。

【数据内容】

该数据集的主题标签为转录组或基因表达,核心内容是对 SAPHO 综合征患者外周血外泌体 miRNA 进行高通量测序所获得的表达谱。研究通过高通量测序方式分析外泌体 miRNA 的表达情况,用于识别与 SAPHO 综合征相关的关键 miRNA。数据集英文名称明确指向“SAPHO 患者循环外泌体 miRNA 的高通量测序表达谱”,说明其数据主体为 miRNA 表达谱信息。关于样本数量、测序平台、数据文件格式与规模等具体细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。研究对象为 SAPHO 综合征患者,样本类型为外周血外泌体,检测手段为高通量测序,检测对象为 miRNA 表达。研究目的为分析 SAPHO 患者外周血外泌体 miRNA 表达谱,识别关键 miRNA,并探索潜在生物标志物。关于样本采集的具体流程、入组标准、对照设置及伦理审批等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与 SAPHO 综合征相关的 miRNA 表达谱研究,可用于识别与该疾病相关的关键 miRNA,支持潜在生物标志物的探索性分析。鉴于 SAPHO 综合征临床表现多样、病因认识不足且诊断和治疗受限,该表达谱数据可用于围绕疾病诊断、治疗及发病机制开展的研究场景。数据集主题涉及转录组或基因表达,也可用于外泌体 miRNA 表达分析相关的方法学研究。关于具体分析流程与验证实验的设计,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 ncbi.nlm.nih.gov 获取。使用时可根据研究目的对 miRNA 表达谱进行分析,以识别与 SAPHO 综合征相关的关键 miRNA,并在此基础上探索潜在生物标志物。关于数据下载的具体入口、文件组织方式、预处理步骤及分析工具等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为高通量测序获得的表达谱数据,其研究目的侧重于识别关键 miRNA 与探索潜在生物标志物。SAPHO 综合征为罕见疾病,临床表现多样且病因认识不足,这些疾病层面的特点构成了解读与应用相关数据时需要考虑的背景。关于数据质量评估指标、样本量、批次效应及验证程度等信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,英文名称为 PRJNA934144: Profiles of circulating exosomal miRNA in SAPHO patients by high-throughput sequencing。关于具体的引用方式与许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA934144

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

滑膜炎、痤疮、脓疱病、骨肥厚和骨炎(SAPHO)综合征是一种罕见疾病,以骨骼和皮肤的自身炎症性病变为特征。其表现多样且病因学认识不足,限制了该病的诊断和治疗。SAPHO综合征也被归类为原发性炎症性骨炎。该病的骨关节受累通常起病隐匿,相关生物标志物可能对诊断、治疗以及阐明SAPHO的发病机制具有重要意义。在本研究中,我们分析了SAPHO患者外周血中的外泌体miRNA表达谱,以识别与该疾病相关的关键miRNA,并尝试寻找可作为SAPHO综合征潜在生物标志物的新分子。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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