PRJNA702124：PDGFRa谱系白细胞外渗至特应性皮炎皮肤的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA702124

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

循环白细胞群体中包含一部分来源于胚胎发育过程中曾短暂表达PDGFRa的祖细胞（PDGFRa谱系）的细胞。在炎症过程中，外渗至炎症组织中的白细胞会改变组织驻留白细胞群体，并与基质细胞发生交互作用。本研究探讨来源于PDGFRa谱系的外渗白细胞对特应性皮炎（AD）皮肤的影响。从PDGFRa谱系标记小鼠中分离谱系阴性骨髓祖细胞，该小鼠以tdTomato标记来源于PDGFRa谱系的细胞。将来源于PDGFRa谱系或非PDGFRa谱系的祖细胞移植至经辐照的EGFP转基因小鼠，使其进行骨髓重建（BMT）。随后通过连续六次局部涂抹MC903诱导AD。第14天，从炎症皮肤中提取RNA并构建文库进行bulk RNA测序。比较PDGFRa谱系与非PDGFRa谱系BMT的AD皮肤转录组。此外，将获得的数据集与白细胞外渗的流式细胞术检测结果配对，以比较外渗负荷相似的样本。

我们通过功能富集分析发现，外渗的PDGFRa谱系白细胞具有不同于非PDGFRa谱系的内在特性，能协调更强的炎症反应并调节细胞外基质。总体设计：对接受受控PDGFRa谱系来源骨髓祖细胞移植的EGFP转基因小鼠的AD皮肤进行转录组分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。