PRJNA1530429:Cxcr2 缺失重塑成年雄性小鼠骨髓转录组并与骨稳态受损相关

该数据集为 NCBI BioProject 收录的 PRJNA1530429 项目,主题为转录组或基因表达,聚焦 Cxcr2 缺失对成年雄性小鼠骨髓转录组的重塑及其与骨稳态受损的关联

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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA1530429: Cxcr2 deficiency reshapes the bone marrow transcriptome and is associated with impaired bone homeostasis in adult male mice

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1530429:Cxcr2 缺失重塑成年雄性小鼠骨髓转录组并与骨稳态受损相关

PRJNA1530429 是 NCBI BioProject 收录的一项生物项目,英文标题为“Cxcr2 deficiency reshapes the bone marrow transcriptome and is associated with impaired bone homeostasis in adult male mice”。该项目以转录组或基因表达为主题标签,聚焦 Cxcr2 缺失对成年雄性小鼠骨髓转录组的重塑,以及这一改变与骨稳态受损之间的关联。从项目标题所传达的信息看,研究对象为成年雄性小鼠,研究核心在于 Cxcr2 基因缺失背景下骨髓转录组的变化,并进一步将这种分子层面的改变与骨稳态受损联系起来。该数据集在分类上归入肌肉骨骼系统疾病 / 其他,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,适合关注骨髓转录调控、骨代谢与骨稳态机制的研究者参考使用。

【数据集背景】

Cxcr2 是一种趋化因子受体,在免疫细胞迁移、炎症反应以及组织微环境调控中具有重要作用。骨髓是造血与免疫细胞发育的重要场所,同时也是骨稳态维持的关键微环境。该项目以成年雄性小鼠为对象,围绕 Cxcr2 缺失展开研究,旨在从骨髓转录组层面揭示 Cxcr2 缺失所引发的分子改变,并将其与骨稳态受损这一表型建立关联。项目标题明确指向“reshapes the bone marrow transcriptome”和“impaired bone homeostasis”,说明其研究重点既包括骨髓转录组的整体重塑,也涉及骨稳态异常。该 BioProject 记录作为相关生物数据的统一入口,便于用户查找该项目所产生的多种数据类型。

【数据内容】

该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。项目标题提示,数据涉及 Cxcr2 缺失条件下成年雄性小鼠骨髓转录组的改变,以及与骨稳态受损相关的信息。源站描述指出,BioProject 是围绕单一研究计划收集生物数据的记录,来源于单一组织或联盟,并为用户提供查找该项目所生成不同数据类型的统一入口。因此,该数据集的内容应理解为与 Cxcr2 缺失、骨髓转录组重塑和骨稳态受损相关的转录组或基因表达数据集合。除上述信息外,关于具体样本数量、测序平台、表达矩阵、差异基因列表等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject,项目编号为 PRJNA1530429,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站标题显示为“Cxcr2 deficiency reshapes the bone marrow transcri... (ID 1530429) - BioProject - NCBI”。根据源站描述,BioProject 记录用于汇集与单一研究计划相关的生物数据,这些数据来自单一组织或联盟,并为用户提供查找该项目所生成不同数据类型的统一入口。该项目的分类为肌肉骨骼系统疾病 / 其他,主题标签为转录组或基因表达。关于样本采集地点、采集时间、实验动物来源、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与骨髓转录组、基因表达调控、Cxcr2 功能、骨稳态及肌肉骨骼系统疾病相关的研究场景。研究人员可将其用于了解 Cxcr2 缺失对成年雄性小鼠骨髓转录组的影响,并探索转录组重塑与骨稳态受损之间的潜在联系。由于主题标签为转录组或基因表达,该数据也可用于基因表达分析、差异表达研究以及转录调控机制探讨等通用场景。此外,该 BioProject 记录可作为入口,帮助用户定位该项目所关联的不同数据类型。关于具体分析流程、推荐工具或特定疾病模型的应用,源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问项目编号 PRJNA1530429,以获取该项目的记录信息,并借助 BioProject 提供的统一入口查找该项目生成的不同数据类型。由于源站描述强调 BioProject 记录提供单一入口以链接项目产生的多样数据类型,使用者可据此进一步定位相关的转录组或基因表达数据。关于数据下载方式、文件格式、分析软件、参数设置等具体操作,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公开数据库收录的项目记录。其主题标签为转录组或基因表达,项目标题明确指向 Cxcr2 缺失、骨髓转录组重塑与骨稳态受损。但关于样本量、测序深度、数据完整性、质控指标、批次效应、统计方法等质量相关信息,源站未提供。此外,该项目标题限定为成年雄性小鼠,因此其结论是否适用于其他性别、年龄或物种,源站未提供。使用者应结合源站记录及关联数据自行评估适用性。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI BioProject,项目编号为 PRJNA1530429,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或版权声明,源站未提供。使用者应遵循 NCBI 及相关数据提供方的通用使用规范,并在引用时参考源站记录中的正式说明。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1530429

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

C-X-C趋化因子受体2(CXCR2)参与白细胞运输和炎症信号传导。为了研究其在骨骼稳态中的作用,我们对成年雄性Cxcr2缺失小鼠及其野生型同窝对照组的股骨骨髓转录组进行了分析。该RNA-seq数据集构成了一个多组织研究的骨髓部分,该研究还通过微阵列分析了关节软骨和软骨下骨。

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