胶原诱导与抗体诱导关节炎小鼠膝关节滑膜单细胞RNA测序
该数据集为 BioProject 收录的胶原诱导与抗体诱导关节炎（C&AIA）小鼠膝关节滑膜单细胞 RNA 测序数据，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，属于肌肉骨骼系统疾病相关转录组数据
基本信息
资源简介
胶原诱导与抗体诱导关节炎小鼠膝关节滑膜单细胞RNA测序
PRJNA1502579 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物学项目，全称为“Single-cell RNA sequencing of knee joint synovium from mice with collagen- and antibody-induced arthritis (C&AIA)”。该项目围绕胶原诱导与抗体诱导关节炎（C&AIA）小鼠模型展开，对其膝关节滑膜组织进行单细胞 RNA 测序，所产生的数据属于转录组或基因表达范畴。从疾病分类角度看，该数据集归入肌肉骨骼系统疾病相关数据，聚焦于关节炎这一具体方向。BioProject 作为生物数据的集合性记录，将同一项目下产生的多种数据类型汇聚于一处，便于用户集中查找与访问。该数据集的核心价值在于以单细胞分辨率刻画关节炎小鼠膝关节滑膜的转录组特征，为相关研究提供原始数据资源。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库，项目编号为 PRJNA1502579。其研究对象为经胶原诱导与抗体诱导方式建立的关节炎小鼠模型，即 C&AIA 模型。关节炎是一类以关节滑膜炎症为主要表现的肌肉骨骼系统疾病，滑膜组织在疾病发生发展中具有关键作用。采用单细胞 RNA 测序技术对膝关节滑膜进行分析，有助于在单个细胞层面观察组织内不同细胞群体的基因表达状况。该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据性质属于转录组或基因表达类数据。
【数据内容】
该数据集的内容为小鼠膝关节滑膜的单细胞 RNA 测序数据，样本来自胶原诱导与抗体诱导关节炎（C&AIA）小鼠。测序对象为膝关节滑膜组织，数据主题归类为转录组或基因表达。除此之外，关于样本数量、测序平台、测序深度、细胞数量、基因数量、数据文件格式与规模等具体信息，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，以 BioProject 形式收录，项目编号 1502579。BioProject 是由单一机构或联盟发起、围绕某一项研究计划所产生的一组生物学数据集合，其记录为用户提供统一入口，以链接到该项目下产生的多种数据类型。关于样本采集的具体时间、地点、实验操作流程、测序机构及伦理审批等信息，源站未提供。
【适用场景】
基于其数据属性，该数据集适用于与关节炎相关的转录组研究场景，例如在单细胞层面考察膝关节滑膜组织中细胞类型构成与基因表达特征。其主题标签“Transcriptome or Gene expression”表明可用于基因表达分析类研究。该数据集归入肌肉骨骼系统疾病范畴，可供关注关节炎发病机制、滑膜病理变化等方向的研究者参考使用。关于该数据集是否适用于其他特定分析目的，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录形式提供，用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问项目编号 PRJNA1502579 对应的记录，并经由记录中的链接获取该项目下产生的各类数据。关于具体的数据下载方式、分析流程、推荐工具及参数设置等信息，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 BioProject 收录的项目记录，其描述指出 BioProject 记录的作用是提供统一入口以链接项目下多种数据类型。关于该数据集的数据质量指标、质控结果、批次效应、覆盖度及潜在偏差等信息，源站未提供。使用者在开展分析时，应结合源站记录中的实际数据自行评估。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1502579
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
类风湿关节炎（RA）是一种慢性自身免疫性疾病，以滑膜炎症、免疫细胞浸润和进行性关节破坏为特征。常用的小鼠模型各有实际局限：胶原诱导性关节炎（CIA）在很大程度上局限于DBA/1品系，而胶原抗体诱导性关节炎（CAIA）则受限于抗体成本。为了将品系灵活性与稳健且可重复的效应期相结合，我们在C57BL/6背景上建立了胶原和抗体诱导性关节炎（C&AIA）。为了表征该模型的滑膜细胞图谱，我们对取自关节炎性C&AIA小鼠炎症膝关节的滑膜组织进行了基于液滴的单细胞RNA测序。该数据集解析了C&AIA滑膜的免疫和基质区室，并使得能够与人类RA滑膜单细胞数据进行跨物种比较。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
