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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1399724：蛋白质组与转录组分析鉴定 TIPRL 为 1q 增益多发性骨髓瘤的潜在靶点

PRJNA1399724 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目记录，其英文名称为“Proteomic and transcriptomic profiling identifies TIPRL as a potential target in multiple myeloma with 1q gain”。该项目围绕伴 1q 增益的多发性骨髓瘤，开展蛋白质组与转录组层面的分析，旨在鉴定 TIPRL 作为潜在靶点。从主题标签看，该项目涉及转录组或基因表达数据。本站将其归入肌肉骨骼系统疾病 / 其他类别。BioProject 记录本身是围绕某一项研究计划汇集生物数据的入口，为用户提供链接到该项目所产生的多种数据类型的位置。以下依据该记录及其来源信息，对该数据集进行介绍。

【数据集背景】

多发性骨髓瘤是一种涉及浆细胞的血液系统恶性肿瘤，细胞遗传学异常与其疾病进展和预后密切相关，其中 1q 增益是较常见的染色体异常之一。该 BioProject 以“伴 1q 增益的多发性骨髓瘤”为研究对象，通过蛋白质组与转录组两个层面的分析，寻找该亚型中可能具有治疗意义的分子靶点，并将 TIPRL 识别为潜在靶点。项目标题直接体现了这一研究目标，即通过蛋白质组和转录组分析来鉴定 TIPRL 的潜在靶点地位。该记录来源于 NCBI BioProject，属于围绕单一研究计划组织起来的生物数据集合。

【数据内容】

该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据涉及转录组或基因表达层面。项目标题同时提到蛋白质组与转录组分析，说明该项目的数据类型覆盖蛋白质组和转录组两个维度。BioProject 记录的作用是提供一个统一入口，使用户能够找到该项目所产生的多种数据类型。除上述信息外，关于样本数量、具体组学平台、数据文件格式、数据量等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，记录标识为 BioProject ID 1399724。BioProject 是由单一组织或联盟发起的、与某一项研究计划相关的生物数据集合；每条 BioProject 记录为用户提供单一位置，以便查找该项目产生的多种数据类型。该项目的英文名称和源站标题均指向同一项关于伴 1q 增益的多发性骨髓瘤的研究。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体研究机构等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于关注多发性骨髓瘤分子机制与靶点发现的研究场景，尤其是针对伴 1q 增益这一亚型的蛋白质组与转录组联合分析。由于主题标签涉及转录组或基因表达，该项目也可用于基因表达层面的探索性分析。对于希望寻找多发性骨髓瘤潜在治疗靶点、特别是 TIPRL 相关研究方向的人员，该 BioProject 可作为获取相关数据的入口。此外，由于 BioProject 记录汇集了同一研究计划下的多种数据类型，该数据集也适合用于跨组学数据整合分析的场景。关于具体分析流程、推荐工具或下游应用，源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录（ID 1399724）访问该项目，并借助记录中提供的链接查找该项目产生的多种数据类型。BioProject 的设计目的即在于为用户提供单一位置，以便定位与某一研究计划相关的各类数据。因此，使用该数据集时，通常先访问 BioProject 页面，再根据页面指引跳转至相应的数据资源。关于数据下载方式、文件组织方式、是否需要申请权限等，源站未提供。

【质量与限制】

该记录来自 NCBI BioProject，属于生物数据项目的登记与索引信息。其标题和主题标签提供了项目研究方向和数据类型的基本线索，但记录本身并不等同于完整的实验数据或分析结果。关于数据质量评估指标、样本量、批次效应、数据完整性等信息，源站未提供。此外，本站分类为“肌肉骨骼系统疾病 / 其他”，而多发性骨髓瘤在临床归类上通常属于血液系统疾病，使用该分类时需注意其可能带来的检索偏差。关于该数据集的局限性，源站未提供更多说明。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，记录标识为 BioProject ID 1399724，英文名称为“PRJNA1399724: Proteomic and transcriptomic profiling identifies TIPRL as a potential target in multiple myeloma with 1q gain”。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用限制或授权要求，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE315888

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数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1399724

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

染色体1q的扩增或获得（+1q）是一种常见的基因组改变，发生于近40%的多发性骨髓瘤患者的浆细胞中。尽管它与不良预后相关，并且在复发或难治性晚期疾病阶段更为常见，但+1q在蛋白质组水平上的影响仍不清楚。在此，我们研究了新诊断的多发性骨髓瘤中富集的CD138+骨髓浆细胞，以揭示与+1q相关的分子改变。差异表达分析显示，由1q区域编码的几种蛋白质表达显著增加，表明可能存在基因剂量效应。通路富集分析发现细胞周期蛋白的富集。此外，蛋白质-蛋白质相互作用网络分析显示，在+1q病例中MYC转录靶点富集，包括位于1q23的TIPRL表达增加。与这些发现一致，在CoMMPass数据集中，TIPRL转录本表达增加与不同细胞遗传学亚组中的+1q相关。高TIPRL蛋白表达与超二倍体亚组患者的不良预后相关。

总体而言，本研究强调了蛋白质组学在理解多发性骨髓瘤（MM）中与染色体改变相关的分子事件以及识别潜在靶点以进行进一步功能分析方面的作用。总体设计：1q获得/扩增（+1q）是多发性骨髓瘤中常见的基因组改变，常与不良预后相关，而识别因这一拷贝数增加而导致失调的基因仍然具有重大意义。对来自34例未经治疗的多发性骨髓瘤患者（14例携带+1q，20例不携带+1q）的样本进行了相关性分析，涉及RNA和蛋白质组数据集中共有的6,731个基因。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别