PRJNA1380250：CD4 T细胞来源IL-2拮抗雷帕霉素介导的急性GvHD中CD8 T细胞效应分化抑制

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1380250

标准获取流程：

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

移植物抗宿主病(GvHD)仍然是以异基因造血干细胞移植成功的主要限制。雷帕霉素作为一种mTOR抑制剂，用于控制同种反应性T细胞反应，但其在体内对供者T细胞亚群分化的影响尚未完全明了。我们之前鉴定了在急性GvHD期间出现的两种主要的同种反应性CD8⁺T细胞亚群，包括TCF1⁺祖细胞样和Tim-3⁺终末效应群体。在本研究中，我们探讨了雷帕霉素如何影响小鼠急性GvHD模型中有无供者CD4⁺T细胞辅助情况下供者CD8⁺T细胞的活化、循环和分化状态。对来自多种实验条件的供者来源T细胞进行了单细胞RNA测序，以定义与雷帕霉素治疗、CD4⁺T细胞参与及效应承诺相关的转录程序。该数据集有助于进一步研究mTOR抑制下GvHD期间调节T细胞分化的细胞机制。

总体设计：雌性C57BL/6（H-2ᵇ）受体小鼠接受致死剂量照射后，移植供体BALB/c（H-2ᵈ）骨髓，同时单独输注纯化的CD8⁺ T细胞或CD4⁺与CD8⁺ T细胞的组合。在指定实验组中给予雷帕霉素，以评估其对供体T细胞体内活化与分化的影响。比较了四种实验条件：无雷帕霉素的CD8⁺ T细胞输注、有雷帕霉素的CD8⁺ T细胞输注、无雷帕霉素的CD4⁺ + CD8⁺ T细胞输注，以及有雷帕霉素的CD4⁺ + CD8⁺ T细胞输注。在特定时间点从循环和GvHD靶组织中分离供体来源的T细胞，并使用10x Genomics 5′单细胞基因表达平台进行分析。所得数据集能够表征急性GvHD期间与雷帕霉素治疗及CD4⁺辅助作用相关的转录状态。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。