iMSC来源细胞外囊泡及其miRNA货物在体外骨关节炎模型中对炎症与氧化损伤的影响
该数据集来自NCBI,聚焦iMSC来源细胞外囊泡(iEVs)及其miRNA货物在体外骨关节炎模型中对炎症和氧化损伤的调控作用

基本信息
资源简介
iMSC来源细胞外囊泡及其miRNA货物在体外骨关节炎模型中对炎症与氧化损伤的影响
PRJNA1363934 数据集来自 NCBI,主题标签为转录组或基因表达,聚焦诱导多能干细胞来源间充质干细胞(iMSC)所衍生的细胞外囊泡(iEVs)及其 miRNA 货物,在体外骨关节炎模型中对炎症和氧化损伤的调控作用。骨关节炎是一种以进行性软骨降解和相关炎症为特征的多因素慢性关节疾病,目前尚无有效治愈手段,间充质干细胞移植等新兴疗法仍在研究中,但受供体依赖变异性和组织来源异质性等限制。该数据集围绕 iMSC 来源囊泡这一无细胞治疗思路,提供与基因表达相关的数据资源,服务于骨关节炎炎症与氧化损伤机制研究。
【数据集背景】
骨关节炎是一种多因素慢性关节疾病,以进行性软骨降解和相关炎症为特征。由于目前没有有效治愈方法,间充质干细胞(MSC)移植等新兴治疗策略正在研究之中。然而,基于 MSC 的疗法在临床转化中受到若干限制,包括供体依赖的变异性以及与组织来源相关的异质性。为解决这些问题,研究者提出将源自诱导多能干细胞(iPSC)的间充质干细胞(iMSC)作为更具标准化和可扩展性的替代方案。考虑到细胞治疗的风险,细胞外囊泡(EVs),特别是 iMSC 来源的细胞外囊泡(iEVs),可能成为骨关节炎治疗中有前景的无细胞途径。本研究旨在表征 iMSC 来源的细胞外囊泡,并评估其在调节炎症方面的功能作用。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。数据集围绕 iMSC 来源细胞外囊泡(iEVs)及其 miRNA 货物展开,关注这些囊泡货物在体外骨关节炎模型中对炎症和氧化损伤的影响。关于数据的具体样本数量、测序平台、文件格式、数据量大小以及 miRNA 靶标列表等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),数据集标识为 PRJNA1363934。其研究背景涉及 iMSC 来源细胞外囊泡的表征及其在体外骨关节炎模型中的功能评估。关于样本采集的具体组织来源、供体信息、培养条件、测序或检测的具体实验流程,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肌肉骨骼系统疾病特别是骨关节炎相关的研究场景,可用于探索 iMSC 来源细胞外囊泡及其 miRNA 货物对炎症和氧化损伤的调控作用。其转录组或基因表达数据属性使其适合用于基因表达层面的分析,例如评估 iEVs 处理后在体外骨关节炎模型中相关基因表达变化的研究方向。关于具体可支持的统计分析方法或验证性应用,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、预处理流程、分析工具或代码等均未说明。使用者需依据 NCBI 平台的一般数据访问规范自行获取与处理。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息、数据完整性说明或已知限制。该数据集聚焦于体外骨关节炎模型,其结论向体内或临床场景的外推程度源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用时应遵循 NCBI 平台的相关数据使用政策,具体引用要求需另行核实。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1363934
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- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
骨关节炎是一种多因素慢性关节疾病,以进行性软骨退变及相关炎症为特征。由于目前尚无有效治愈方法,间充质基质细胞(MSCs)移植等新兴治疗手段正在研究中。然而,基于MSCs的疗法的临床转化受到若干局限性的阻碍,例如供者依赖性变异以及与组织来源相关的异质性。为解决这些问题,源自诱导多能干细胞间充质基质细胞(iMSCs)被提出作为一种更标准化且可规模化的替代方案。鉴于细胞疗法的风险,细胞外囊泡(EVs),尤其是iMSC-EVs(iEVs),可能代表一种有前景的无细胞方法用于骨关节炎治疗。本研究旨在表征iMSC来源的EVs,并在体外骨关节炎模型中评估其在调节炎症反应和氧化还原平衡中的功能作用。值得注意的是,近期证据强调了EV包裹的microRNAs(EV-miRNAs)在介导这些效应中的核心作用。
方法 对从iMSC条件培养基中分离的EVs进行了表征,并分析了不同培养传代次数下其miRNA含量。随后在体外OA模型中评估了所选miRNA的生物学活性,重点关注其对炎症介质和氧化应激参数的影响。结果 上调miRNA在体外OA模型中的作用报告显示促炎细胞因子的表达水平降低。此外,该处理显著改善了ROS积累和氧化损伤,恢复了抗氧化防御。具体而言,hsa-miR-17-5p、has-miR-20a-5p、has-miR-21-5p、has-miR-29a-3p、has-miR-29b-3p和has-miR-29c-3p等miRNA差异性地反映了iMSCs-EVs处理的抗炎和抗氧化作用,提示可能存在协同效应。讨论 这些发现支持iMSC来源的EVs作为
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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