PRJNA1191007：MSC来源细胞外囊泡的microRNA测序

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1191007

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

人骨髓来源的间充质干细胞（MSCs）分别经健康个体或ARDS、囊性纤维化、囊性纤维化合并曲霉阳性患者的支气管肺泡灌洗液（BALF）刺激，或以未处理的MSCs作为对照。按照国际细胞外囊泡学会关于细胞外囊泡及其功能定义的最低实验要求（J Extracell Vesicles. 2014 Dec 22:3:26913. doi: 10.3402/jev.v3.26913. eCollection 2014），从MSC条件培养基中分离细胞外囊泡。在本研究的第1阶段，采用差异表达分析及判别分析，鉴定出与健康对照相比，暴露于ARDS患者BALF的MSCs所来源的细胞外囊泡中有14种微小RNA（microRNAs）存在差异表达。通过体外实验证实了细胞外囊泡对细胞生理的影响，即参与调控囊性纤维化跨膜传导调节因子（CFTR）的两种miRNA——miRNA-145-5p和miRNA-138-5p——在暴露于ARDS BALF的人MSCs来源的细胞外囊泡中也显著升高。

功能上，暴露于ARDS或HV BALF的hMSCs来源的EVs对培养的原代人支气管上皮细胞的CFTR Cl-分泌具有差异化影响，预计该效应会降低黏液纤毛清除功能。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。