PRJDB37798:正常骨髓MSCs中shelterin因子Pot1a的功能分析
该数据集来自NCBI,主题为转录组或基因表达,聚焦正常骨髓间充质干细胞(MSCs)中shelterin因子Pot1a的功能分析

基本信息
资源简介
PRJDB37798:正常骨髓MSCs中shelterin因子Pot1a的功能分析
该数据集来自NCBI,主题为转录组或基因表达,聚焦正常骨髓间充质干细胞(MSCs)中shelterin因子Pot1a的功能分析。源站描述指出造血干细胞依赖骨髓微环境支持,shelterin复合体(含Pot1a/Pot1b)通过形成T-loop保护端粒并抑制DNA损伤应答,且前期工作显示Pot1a对维持造血干细胞功能至关重要、其表达随衰老下降。数据可用于研究Pot1a在骨髓MSCs及微环境维持中的作用与基因表达特征(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):造血干细胞(HSCs)驻留在骨髓微环境(即niche)中,其功能通过与周围niche细胞的相互作用得以维持。近期研究表明,不仅正常HSCs,白血病干细胞(LSCs)也依赖骨髓niche细胞的支持信号(Maher et al., Cell Stem Cell, 2014)。端粒位于染色体末端,由于其富含G的重复序列和单链3'突出端而易于受损。由包括POT1(小鼠中为Pot1a和Pot1b)在内的六种核心蛋白组成的shelterin复合体,通过形成T-loop结构并抑制DNA损伤应答,在保护端粒中发挥关键作用(de Lange et al., Science, 2009)。我们前期工作证明Pot1a对维持HSC功能至关重要,且其表达在衰老过程中下降(Hosokawa K. et al., 20
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB37798
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB37798
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
造血干细胞(HSCs)存在于骨髓微环境(即龛)中,其功能通过与周围龛细胞的相互作用得以维持。近期研究表明,不仅正常HSCs,白血病干细胞(LSCs)也依赖于骨髓龛细胞的支持信号(Maher等,Cell Stem Cell,2014)。端粒位于染色体末端,由于其富含G的重复序列和单链3’悬突,容易受到损伤。由包括POT1(小鼠中为Pot1a和Pot1b)在内的六种核心蛋白组成的shelterin复合体,通过形成T环结构和抑制DNA损伤反应,在保护端粒方面发挥关键作用(de Lange等,Science,2009)。我们先前的工作证明,Pot1a对维持HSC功能至关重要,且其表达在衰老过程中下降(Hosokawa K.等,2017)。后续研究揭示,Pot1a表达在骨髓间充质干细胞(MSCs)中也随年龄增长而下降,MSCs是支持造血的关键龛细胞(Nakashima K.等,2023)。
这些发现提示Pot1a也可能有助于MSCs的存活和造血支持能力。在本研究中,我们旨在阐明Pot1a在维持骨髓MSCs造血支持功能中的作用。为此,我们通过将LepR-Cre小鼠与Pot1a^fl/fl^小鼠杂交,构建了在LepR阳性MSCs中特异性缺失Pot1a的条件性敲除小鼠(Pot1a条件性敲除:Pot1a-cKO)。目前正在对这些小鼠的MSCs进行转录组学和分子分析,以阐明Pot1a调控MSC功能及造血支持的机制。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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