颅缝早闭症儿童组织成骨特性分析数据集

该数据集来源于clinicaltrials.gov,聚焦颅缝早闭症(Craniosynostosis)儿童患者的组织成骨特性分析

University of PittsburghUniversity of Pittsburgh
clinicaltrials
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基因组分类Craniosynostosis
Osteogenic Profiling of Tissue From Children With Craniosynostosis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

颅缝早闭症儿童组织成骨特性分析数据集

Osteogenic Profiling of Tissue From Children With Craniosynostosis 是一个以颅缝早闭症(Craniosynostosis)儿童患者为对象的组织成骨特性分析数据集,来源为 clinicaltrials.gov,在本站归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他。该数据集围绕颅缝早闭症的临床诊断、遗传筛查与外科修复过程组织信息,主题标签为 Craniosynostosis。其核心价值在于将颅缝早闭症儿童患者的组织成骨特性分析与临床诊疗流程相关联,为理解该疾病的生物学特征与临床管理提供数据基础。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制、引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

颅缝早闭症是颅骨缝过早闭合导致颅面骨骼形态异常的一类疾病,临床上面临诊断分型、是否需要手术干预以及手术修复方案制定等问题。该数据集聚焦于颅缝早闭症儿童患者组织的成骨特性分析,试图在标准临床诊疗流程中同步获取与成骨相关的组织信息。源站描述显示,研究涉及对患者病历信息的复核与采集,包括姓名、出生日期、病历号、颅缝早闭症分类的临床诊断、针对综合征型颅缝早闭的基因筛查(FGFR、TWIST、MSX2 突变筛查),以及在颅面裂中心进行的临床检查。这些背景信息构成了数据集所依托的临床与研究语境。

【数据内容】

数据集的内容围绕颅缝早闭症儿童患者的临床与组织成骨特性信息展开。根据源站描述,筛查程序包括从患者病历中复核和采集信息,具体涵盖姓名、出生日期、病历号、颅缝早闭症分类的临床诊断、针对综合征型颅缝早闭的基因筛查(FGFR、TWIST、MSX2 突变筛查),以及在颅面裂中心进行的临床检查。临床检查中,整形外科医生将判定是否存在颅缝早闭症以及是否需要外科干预。数据集的主题标签为 Craniosynostosis,整体指向儿童患者组织的成骨特性分析。除上述内容外,源站未提供更细化的数据字段、样本量或具体测量指标。

【采集与来源】

该数据集来源于 clinicaltrials.gov。采集过程与临床诊疗流程相结合:筛查程序包括复核和采集患者病历信息,开展针对综合征型颅缝早闭的基因筛查,并在颅面裂中心进行临床检查,由整形外科医生判定颅缝早闭症的存在及手术干预的必要性。源站描述还指出,这些颅缝早闭症患者的评估与手术修复不会偏离常规,也不会偏离当前的标准诊疗。为重建、重塑和扩大畸形颅面骨骼的轮廓,手术过程中需要较大的皮肤切口和皮下分离,以在操作期间获得充分暴露。数据集的采集场景即建立在这一标准临床诊疗与手术修复过程之上。

【适用场景】

基于其主题与内容,该数据集适用于与颅缝早闭症相关的临床研究和分析场景,例如围绕儿童患者颅缝早闭症的临床诊断分类、综合征型颅缝早闭的基因筛查信息(FGFR、TWIST、MSX2 突变筛查)以及组织成骨特性分析的研究。也可用于理解颅缝早闭症患者从临床检查、手术必要性判定到外科修复的诊疗路径。由于数据集聚焦儿童患者组织成骨特性,其潜在用途还包括支持对颅面骨骼畸形修复相关临床管理的研究。具体适用场景应以源站描述所覆盖的范围为限,源站未提供更明确的适用场景说明。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据访问方式、文件格式、字段说明、分析流程或配套工具等信息。使用者需依据来源站 clinicaltrials.gov 的相关说明获取进一步信息。就现有描述而言,数据集内容与临床筛查、基因筛查和临床检查流程相关联,但如何将这些信息用于成骨特性分析,源站未提供具体方法。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量控制、完整性、准确性或局限性说明。已知信息仅包括研究涉及的临床筛查与检查流程,以及手术修复遵循标准诊疗的描述。数据集的具体样本规模、数据粒度、缺失情况、偏倚控制等质量相关指标,源站未提供。使用者应注意,该数据集来源于 clinicaltrials.gov 的研究描述,其内容范围以源站描述为限,不应推断源站未提及的指标或结论。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者在引用或使用该数据集前,应查阅 clinicaltrials.gov 来源页面的相关说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT00773643

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:颅缝早闭。筛查程序包括查阅和收集患者病历中的信息,姓名、出生日期、病历号、颅缝早闭分类的临床诊断、综合征性颅缝早闭的基因筛查(FGFR、TWIST、MSX2突变筛查),以及在唇腭裂-颅面中心的临床检查。在临床检查期间,整形外科医生将确定是否存在颅缝早闭以及是否需要手术干预。这些颅缝早闭患者的评估和手术修复将与正常情况无异,也不会偏离当前的诊疗标准。为了重建、重塑和扩展变形的颅面骨骼轮廓,需要较大的皮肤切口和皮下剥离,以便在手术过程中获得充分的暴露。这些大切口和剥离是重建的必要组成部分。在手术的正常过程中,颞肌(颞部的一块咀嚼肌)和皮下脂肪将可见并暴露。

只有在整形外科医生获得这一标准暴露范围后,才会从知情同意的患者身上切取最大尺寸为2mm×2mm×3mm的切除活检样本。骨样本将从重建手术中通常会被丢弃的骨组织中采集,因此采集骨样本无需额外操作。活检样本不会提供给二次研究者。肌肉和脂肪活检是研究所需操作。手术时将分别从颞肌、皮下脂肪和骨各取一份组织样本。研究者将审查作为标准诊疗一部分的检测/操作结果,结果将成为研究记录的一部分。研究者将继续使用和披露可识别的医疗信息,并将储存的组织样本保留七年。在此七年

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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