面向10个被忽视热带病与AMR靶点的开放获取变构隐蔽中间构象集合
该数据集提供面向10个被忽视热带病（NTD）与抗菌药物耐药（AMR）高优先级靶点的开放获取变构隐蔽中间态构象集合，几何为s=0.5鞍点构象
基本信息
资源简介
面向10个被忽视热带病与AMR靶点的开放获取变构隐蔽中间构象集合
Open-Access Allosteric Cryptic Intermediate Conformational Ensemble for 10 Neglected Tropical Disease (NTD) & AMR Targets
该数据集提供面向10个被忽视热带病（NTD）与抗菌药物耐药（AMR）高优先级靶点的开放获取变构隐蔽中间态构象集合，几何为s=0.5鞍点构象。传统PDB中的Apo/Holo基态晶体结构难以刻画此类瞬态构象，本数据集以晶体学标准锁定骨架完整性，并声明零双重用途风险。可用于变构隐蔽口袋识别、过渡态中间体建模与靶点结构机制研究（来源 DOI 解析，Creative Commons Attribution 4.0 International 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2026。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：面向10个被忽视热带病（NTD）与AMR靶点的开放获取变构隐蔽中间构象集合 -blue.svg) 1. 概述与人道主义动机 本仓库提供一套开放获取的构象数据集，涵盖变构隐蔽中间态（s=0.5鞍点几何），覆盖被忽视热带病（NTDs）与抗菌药物耐药（AMR）的10个高优先级靶点。蛋白质数据库（PDB）中的传统晶体结构（Apo/Holo基态）
【主题与分类】
主题标签：Allosteric Cryptic Pockets、Transition State Intermediate、Neglected Tropical Diseases (NTD)、Antimicrobial Resistance (AMR)、Trypanothione Reductase、Cruzain, FtsZ、Thioredoxin Glutathione Reductase、InhA、Beta-Lactamase TEM-1、Structural Bioinformatics。本站分类：肌肉骨骼系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.23275200
使用许可：Creative Commons Attribution 4.0 International。
下载信息
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源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23275200
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 2.6 MB。
数据说明
Open-Access Allosteric Cryptic Intermediate Conformational Ensemble for 10 Neglected Tropical Disease (NTD) & AMR Targets 
-blue.svg)
## 1. Overview & Humanitarian Motivation This repository provides an open-access conformational dataset of allosteric cryptic intermediate states (s=0.5 saddle-point geometries) across 10 high-priority targets for Neglected Tropical Diseases (NTDs) and Antimicrobial Resistance (AMR). Traditional crystal structures (Apo/Holo ground states) in the Protein Data Bank (PDB) typically reflect kinetically dormant or locked configurations where allosteric binding grooves are closed (< 500 ų). To accelerate small-molecule inhibitor discovery for populations underserved by commercial pharmaceutical pipelines, this dataset unmasks transient, open-cleft intermediate ensembles (> 1,000 ų) derived via kinematically restrained domain relaxation, while strictly preserving primary crystallographic backbone geometry (1.335 Å peptide bond constraints). All 10 target enzymes are pathogen-exclusive and fundamentally absent from the human proteome, ensuring zero host off-target cytotoxicity and zero dual-use/biological security risk. — ## 2. Target Suite Summary | Index | Target ID | Target Protein Name | Pathogen / Organism | Clinical Indication | Hinge Cleft (Residues) | Cavity Expansion (Burst) || :—: | :—: | :— | :— | :— | :—: | :—: || 01 | 2W02 | Trypanothione Reductase | Trypanosoma brucei | African Sleeping Sickness | 395–415 | +23% (1.23x) || 02 | 1ME3 | Cruzain Cysteine Protease | Trypanosoma cruzi | Chagas D
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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