产后血管生长与尺度调控的微型CT数据集

该数据集为微型计算机断层扫描(micro-computed tomography)数据,来源于 search.dataone.org,主题聚焦产后血管生长与尺度调控,涉及主动脉随脊柱比例生长的规律、增殖波与细胞周期动力学、内皮细胞挤出维持稳态及软骨发育不全模型

dataone
浏览 2
医学影像图像分割organ scalingAortavascular growth
Micro-computed tomography data for: Resolving the design principles that control postnatal vascular growth and scaling

基本信息

模态
医学影像
任务类型
图像分割
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

产后血管生长与尺度调控的微型CT数据集

Micro-computed tomography data for: Resolving the design principles that control postnatal vascular growth and scaling

该数据集为微型计算机断层扫描(micro-computed tomography)数据,来源于 search.dataone.org,主题聚焦产后血管生长与尺度调控,涉及主动脉随脊柱比例生长的规律、增殖波与细胞周期动力学、内皮细胞挤出维持稳态及软骨发育不全模型。数据可用于血管形态与生长的定量分析、图像分割与三维重建研究,支撑血管生长机制与器官尺度调控的探索(来源 DataONE,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):出生后,组织持续生长直至达到成年尺寸,每个器官表现出独特的细胞动力学、生长模式以及干细胞或非干细胞来源。利用多尺度实验与计算方法,我们发现主动脉扩张遵循独特的生长原则,与脊柱成比例缩放。扩张通过两个时间上协调、空间上随机的增殖波推进,并与血流方向一致,每个波具有独特的细胞周期动力学,其中第一个波的周期短至6小时。单细胞RNA测序揭示伴随细胞增大的脂肪酸代谢增加。数学建模与实验表明,内皮细胞挤出对于在主动脉调整增殖过剩时维持稳态尺寸至关重要。利用软骨发育不全的遗传模型,我们从机制上证明主动脉保留

【主题与分类】

主题标签:organ scaling、Aorta、vascular growth。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A73a9ccc7d069d00c6aa7013291deb79013b048cd325041c2e174d9331194b791

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3A73a9ccc7d069d00c6aa7013291deb79013b048cd325041c2e174d9331194b791

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

出生后,组织持续生长直至达到成年尺寸,每个器官都表现出独特的细胞动力学、生长模式以及干细胞或非干细胞来源。通过多尺度的实验与计算方法,我们发现主动脉的扩张遵循独特的生长原则,与脊柱成比例缩放。扩张过程通过两波在时间上协调、空间上随机且与血流方向一致的增殖波进行,每波都具有独特的细胞周期动力学,其中第一波的周期短至6小时。单细胞RNA测序揭示,细胞增大伴随脂肪酸代谢增强。数学建模与实验表明,内皮细胞挤出对于维持稳态下的主动脉尺寸至关重要,因为它能调节增殖过剩。利用软骨发育不全的遗传模型,我们从机制上证明,主动脉通过增加细胞挤出同时保持增殖速率不变来维持适当的比例缩放。

这些发现……,# 解析控制出生后血管生长与比例缩放的设计原则 数据集DOI:10.5061/dryad.kh18932kp 数据按照相关出版物中所述的方法收集。Sam Brennan和Stuart R. Stock(西北大学)收集了microCT数据。Stuart Stock完成了主动脉和椎骨长度的测量。Stuart Stock整理了数据集。数据及文件结构说明 使用Bruker SkyScan 1272对填充了造影剂的小鼠脊柱和主动脉进行microCT扫描 ### 文件与变量 1) 野生型小鼠的microCT切片及元数据 2) osx-cre小鼠的microCT切片及元数据。plus和minus分别表示KO和不表达 该数据集由以下部分组成:1) microCT切片,2) 其相关元数据,对应Cell Systems论文“解析控制出生后血管生长与比例缩放的设计原则”。Danielle Pi、Jonas Braun等(2025年出版中)。数据由以下图像集组成

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案