MedPelvis3D:用于解剖标志点检测的3D骨盆解剖数据集

MedPelvis3D 是一个经过整理的 3D 骨盆解剖数据集,面向自动化解剖标志点检测、解剖测量、姿态估计、几何学习、配准与手术规划等研究

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2026-10-11 更新
浏览 16
医学影像关键点标注3D pelvisanatomical landmarksCTmedical imaging datasetlandmark detectionsurgical planning
MedPelvis3D: a 3D pelvic anatomy dataset for anatomical landmark detection

基本信息

模态
医学影像
大小
15.261867359 GB
任务类型
关键点标注
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-11
版本
4.0.0

资源简介

MedPelvis3D:用于解剖标志点检测的3D骨盆解剖数据集

MedPelvis3D: a 3D pelvic anatomy dataset for anatomical landmark detection

MedPelvis3D 是一个经过整理的 3D 骨盆解剖数据集,面向自动化解剖标志点检测、解剖测量、姿态估计、几何学习、配准与手术规划等研究。该数据集包含 99 例回顾性收集于 Chinese PLA General Hospital 的去标识化骨盆 CT 病例(男性 59 例、女性 40 例)。发布的 STL、NPY 和 CSV 文件中的显式 XYZ 坐标均以毫米为单位、采用患者级 LPS 约定;NIfTI 体积与掩膜保留仿射矩阵以支持体素到物理坐标的映射。每个病例以独立 .zip 归档提供,便于单独选择、下载和处理(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):MedPelvis3D 是一个经过整理的 3D 骨盆解剖数据集,用于自动化解剖标志点检测、解剖测量、姿态估计、几何学习、配准和手术规划等研究。该发布包含 99 例去标识化骨盆 CT 病例(男性 59 例、女性 40 例),回顾性收集于 Chinese PLA General Hospital。发布的 STL、NPY 和 CSV 文件中的所有显式 XYZ 坐标均以毫米为单位、采用患者级 LPS 约定。NIfTI 体积和掩膜保留其仿射矩阵,用于体素到物理坐标的映射。每个病例以单个名为 .zip 的归档提供,以便任何单个病例均可被独立选择、下载和处理。每个归档包含: 一个 NIfTI 格式的去标识化 CT 体积(.nii.gz); 一个 NIfTI 格式的骨盆分割掩膜(-mask.nii.gz),包含 LeftHipBone、RightHipBone 和

【主题与分类】

主题标签:3D pelvis、anatomical landmarks、CT、medical imaging dataset、landmark detection、surgical planning。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.23290740

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 15.26 GB。

数据说明

MedPelvis3D 是一个经过整理的 3D 骨盆解剖数据集,用于自动解剖标志点检测、解剖测量、姿态估计、几何学习、配准和手术规划等研究。该发布版本包含 99 例去标识化骨盆 CT 病例(59 例男性和 40 例女性),这些病例是在中国人民解放军总医院回顾性收集的。发布的 STL、NPY 和 CSV 文件中所有显式 XYZ 坐标均以毫米为单位,采用患者级 LPS 约定表示。NIfTI 体积和掩膜保留其仿射矩阵,用于体素到物理坐标的映射。每个病例均以名为 <case_id>.zip 的单个归档文件提供,因此任何单个病例均可独立选择、下载和处理。

每个归档包含:* 一个去标识化的NIfTI格式CT体积(<case_id>.nii.gz);* 一个NIfTI格式的骨盆分割掩膜(<case_id>-mask.nii.gz),带有LeftHipBone、RightHipBone和Sacrum标签;* 三个重新生成的STL表面网格,分别命名为<case_id>-LeftHipBone.stl、<case_id>-RightHipBone.stl和<case_id>-Sacrum.stl;* 57个专家标注的3D地标,以CSV格式提供(<case_id>-Table-XYZ.CSV),包括标准化的short_name和anatomical_name_en字段;* 一个从骨盆表面网格采样的50,000点参考点云(<case_id>-points-50000.npy);以及* 一个单行metadata.csv文件,包含case_id、sex、age_years、height_cm和weight_kg字段。队列级元数据以patient_metadata.csv形式提供。所有99例均有性别信息;37/99例有身高信息,36/99例有体重信息。发布来源中没有可靠的病例级年龄字段,因此所有病例的age_years均为空白。缺失的人口统计学值保留为空白单元格,未进行插补。

使用scikit-image 0.26.0中的Lewiner移动立方体实现,从清理后的分割掩膜重新生成了297个释放的STL组件(99例×3个结构)。每个组件的朝向均经过调整,使其面片法线指向

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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