DUX4 在成肌细胞中激活 JNK 和 p38 MAP 激酶的 MAJIQ 剪接结果

该数据集来自 search.dataone.org,聚焦面肩肱型肌营养不良症(FSHD)中 DUX4 转录因子在骨骼肌中异常表达所引发的应激反应

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DUX4 expression activates JNK and p38 MAP kinases in myoblasts: MAJIQ splicing results

基本信息

模态
时间序列
许可
CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

DUX4 在成肌细胞中激活 JNK 和 p38 MAP 激酶的 MAJIQ 剪接结果

DUX4 expression activates JNK and p38 MAP kinases in myoblasts: MAJIQ splicing results

该数据集来自 search.dataone.org,聚焦面肩肱型肌营养不良症(FSHD)中 DUX4 转录因子在骨骼肌中异常表达所引发的应激反应。数据包含在成肌细胞中激活 DUX4 表达后的 MAJIQ 剪接分析结果,并关联纵向 RNA 测序、蛋白质组与磷酸化蛋白质组研究,揭示 DNA 损伤、mRNA 剪接改变以及 JNK 和 p38 MAP 激酶通路激活。可用于研究 DUX4 介导的细胞应激、剪接调控与激酶信号机制(来源 DataONE,CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):面肩肱型肌营养不良症(FSHD)由骨骼肌中 DUX4 转录因子的异常表达引起,导致转录改变、异常表型和细胞死亡。为深入了解 DUX4 诱导应激的动力学,我们在成肌细胞中激活 DUX4 表达,并进行了纵向 RNA 测序(GEO GSE205421),同时结合蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学(MassIVE MSV000089812)。该分析揭示了细胞生理变化,包括 DNA 损伤和 mRNA 剪接改变。磷酸化蛋白质组学分析发现,DUX4 诱导后蛋白质磷酸化迅速发生广泛变化,表明激酶信号改变可能在 DUX4 介导的应激和细胞死亡中发挥作用。事实上,我们证明两种应激响应性 MAP 激酶通路 JNK 和 p38 在响应 DUX4 表达时被激活。抑制

【主题与分类】

主题标签:FSHD、JNK、DUX4。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Ae1d541c03104aa660154bc9350eb77b61c1532d20fe66ae6bfac7f00254347df

使用许可:CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

面肩肱型肌营养不良症(FSHD)是由骨骼肌中DUX4转录因子的错误表达引起的,导致转录改变、异常表型和细胞死亡。为了深入了解DUX4诱导应激的动力学,我们在成肌细胞中激活DUX4表达,并进行了纵向RNA测序(GEO GSE205421),结合蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学分析(MassIVE MSV000089812)。该分析揭示了细胞生理变化,包括DNA损伤和mRNA剪接改变。磷酸化蛋白质组学分析发现,DUX4诱导后蛋白质磷酸化迅速发生广泛变化,表明激酶信号传导的改变可能在DUX4介导的应激和细胞死亡中发挥作用。事实上,我们证明两种应激响应性MAP激酶通路——JNK和p38——在DUX4表达后被激活。抑制这两条通路中的每一条均可减轻成肌细胞中DUX4介导的细胞死亡。这些发现揭示了JNK……

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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