冻结肩关节囊单细胞图谱：囊成纤维细胞与MDMs共培养的Bulk RNA-seq

资源简介

冻结肩关节囊单细胞图谱：囊成纤维细胞与MDMs共培养的Bulk RNA-seq

该数据集全称为“A single cell atlas of frozen shoulder capsule identifies features associated with inflammatory fibrosis resolution（Bulk RNA-seq of capsular fibroblasts co-cultured with MDMs）”，来源于 ebi.ac.uk，属于肌肉骨骼疾病 / 其他分类。其主题围绕冻结肩（frozen shoulder）关节囊的单细胞图谱展开，聚焦炎症纤维化消退相关特征，具体实验类型为关节囊成纤维细胞与巨噬细胞（MDMs）共培养后的 Bulk RNA-seq。数据集由 Michael Ng 与 Stephanie Dakin 于 2023 年发布，源站记录编号为 E-MTAB-12312。该资源将冻结肩这一肌肉骨骼疾病的组织层面图谱研究与体外共培养转录组实验相结合，为研究成纤维细胞与巨噬细胞相互作用在炎症纤维化过程中的角色提供了可检索的数据基础。

【数据集背景】

冻结肩是一种以关节囊纤维化和炎症为特征的肌肉骨骼疾病，其病理机制涉及关节囊内多种细胞类型之间的相互作用。该数据集所属研究以“冻结肩关节囊单细胞图谱”为总体框架，旨在识别与炎症纤维化消退相关的特征。作为该研究框架下的组成部分，本数据集专门针对关节囊成纤维细胞与巨噬细胞共培养体系开展 Bulk RNA-seq，用于在转录组层面观察这两种关键细胞群体共培养后的基因表达变化。源站描述中给出的主题标签包括冻结肩、单细胞图谱、炎症纤维化、成纤维细胞、巨噬细胞共培养、Bulk RNA-seq 与肌肉骨骼疾病，这些标签共同界定了该数据集的疾病背景与实验主题。

【数据内容】

该数据集的内容为 Bulk RNA-seq 数据，实验对象是关节囊成纤维细胞与 MDMs（巨噬细胞）共培养的样本。与单细胞水平的转录组不同，Bulk RNA-seq 反映的是共培养体系中细胞群体的整体表达谱。数据集名称中明确标注了“Bulk RNA-seq of capsular fibroblasts co-cultured with MDMs”，说明其数据主体是这一共培养实验产生的测序读数及相关表达信息。关于样本数量、测序深度、基因数目、分组设计等具体指标，源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源站为 ebi.ac.uk，源站记录为 Michael Ng 与 Stephanie Dakin 于 2023 年发布的数据集，记录链接为 https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-12312。该记录归属于 BioStudies 数据库中的 E-MTAB-12312 条目。关于样本采集的具体临床信息、供体特征、伦理审批信息以及测序平台与试剂细节，源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与实验设计，该数据集适用于冻结肩及相关肌肉骨骼疾病中炎症纤维化机制的研究场景，尤其是关注关节囊成纤维细胞与巨噬细胞相互作用的研究。Bulk RNA-seq 数据可用于分析共培养条件下成纤维细胞的整体转录组响应，也可作为单细胞图谱研究的补充或验证性数据来源。此外，该数据可用于比较不同培养条件或不同样本组之间的表达差异，以探索与炎症纤维化消退相关的候选特征。关于该数据集是否适用于其他疾病或细胞类型，源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 BioStudies 条目 E-MTAB-12312 的形式提供，使用者可通过源站链接访问该记录并获取其关联数据。关于数据文件的具体格式、下载方式、预处理流程、标准化方法以及配套分析代码，源站未提供。使用者在分析前应依据源站记录中的说明确认数据组织方式。

【质量与限制】

该数据集为 Bulk RNA-seq，反映的是共培养细胞群体的混合表达信号，无法直接解析单个细胞的表达异质性；其名称中虽含“单细胞图谱”字样，但本条目对应的实验类型为 Bulk RNA-seq。关于样本量、重复数、测序质量指标、批次效应以及数据完整性等信息，源站未提供。使用者在解释结果时需考虑共培养体系与体内关节囊组织之间的差异，相关验证信息源站未提供。

【引用与许可】

引用该数据集时，应参照源站给出的描述格式：Michael Ng; Stephanie Dakin (2023). A single cell atlas of frozen shoulder capsule identifies features associated with inflammatory fibrosis resolution (Bulk RNA-seq of capsular fibroblasts co-cultured with MDMs) [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-12312。关于该数据集的许可条款与使用限制，源站未提供。