mNGS指导的序贯培养策略用于术后交叉韧带重建感染（CLRI）的回顾性队列研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07852598

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数据说明

条件：交叉韧带重建感染、化脓性关节炎、手术伤口感染、关节感染。英文版本：这是一项回顾性、单中心队列研究，评估2015年1月至2026年1月期间因疑似术后交叉韧带重建感染（CLRI）而接受评估的患者。该研究纳入了50例临床诊断为CLRI的患者和30例因无菌性失败（AF）接受翻修手术的对照患者。研究方案：在无菌条件下抽取治疗前滑液，并分为至少三份。常规培养：第一份立即采用常规需氧和厌氧微生物培养方法处理（孵育长达7-14天）。mNGS检测：第二份立即运送进行宏基因组下一代测序（mNGS）检测，以快速识别潜在的微生物核酸。mNGS指导的改良培养：第三份保存于-80°C。

一旦mNGS结果可得（48小时内），临床微生物学家会审核检出的微生物，并针对保存的等分样本对后续培养方案制定个体化修改。这些修改根据疑似病原体的生物学特性量身定制，包括使用专用培养基（如沙氏葡萄糖琼脂、分枝杆菌生长指示管系统）、延长培养时间、严格厌氧条件以及补充鉴定程序。目的与评估：主要目的是比较治疗前常规培养、治疗前mNGS以及序贯mNGS指导的改良培养策略之间的诊断效能（活病原体的阳性检出率）。该研究还评估这种增强的、可操作的微生物学信息如何为个体化临床管理提供依据。具体而言，它评估治疗决策算法——整合病原体特征、感染持续时间和移植物/固定装置的机械稳定性——以确定th

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。