牛源鸟分枝杆菌感染相关肺肉芽肿的转录组学数据:揭示多细胞免疫网络与牛结核病生物标志物
该数据集是一个包含牛肺组织转录组测序数据的生物医学研究数据集,其数据模态为基因表达谱(转录组数据)。它系统研究了由牛源鸟分枝杆菌自然感染引起的肺肉芽肿的转录组学特征,揭示了与免疫调节和病理重塑相关的关键基因与通路,并通过比较分析鉴定出多个潜在的牛结核病诊断生物标志物,主要用于牛结核病的发病机制探索和新型诊断工具开发。
https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Transcriptomic_insights_into_i_Mycobacterium_orygis_i_infection-associated_pulmonary_granulomas_reveal_multicellular_immune_networks_and_tuberculosis_biomarkers_in_cattle/29163477/1
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资源简介
该数据集是一项关于牛结核病(bovine tuberculosis, bTB)的转录组学研究数据集,聚焦于牛源鸟分枝杆菌(Mycobacterium orygis)感染引起的肺肉芽肿。数据集包含通过高通量RNA测序技术获取的牛肺组织转录组数据,来源于自然感染M. orygis的牛只肺肉芽肿样本。研究通过组织病理学分析揭示了由M. orygis诱导的严重肺病理特征,包括多阶段肉芽肿、坏死和空洞性病变。转录组分析识别了大量与免疫应答调节和细胞外基质重塑相关的差异表达基因和失调通路。细胞类型富集分析深入解析了肉芽肿微环境中的多细胞组成和复杂的细胞间相互作用。此外,通过利用公开的牛和人类结核病组学数据集进行比较转录组学分析,研究鉴定出14个关键的免疫调节因子(如SOD2、IL1α/β、CXCL10等)作为牛活动性结核病的潜在生物标志物。该数据集主要应用于牛结核病的发病机制研究、新型诊断生物标志物发现以及比较医学研究,为疾病管理和控制工具的研发提供了重要资源。
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