疟疾:细胞图像数据集

数据覆盖感染与未感染两类细胞形态,适用于疟疾相关的细胞图像二分类任务,可用于训练和评估感染检测模型(来源 Mendeley Data)

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2022-08-11 更新
浏览 2
图像分类疟疾寄生虫病细胞图像感染检测图像分类
Malaria: cell images

基本信息

模态
图像
大小
0.355937164 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2022-08-11
版本
v1

资源简介

疟疾:细胞图像数据集

“Malaria: cell images”是一个面向疟疾细胞图像二分类研究的公开数据集,收录了感染与未感染两类细胞形态图像,共27,558张,按寄生感染与未感染两个文件夹组织,以ZIP压缩包形式提供下载。该数据集发布于2022年8月11日,当前版本为v1,DOI为10.17632/y7z2vg7fmy.1,来源为Mendeley Data,在本站归入感染/寄生虫病分类。其图像规模与二分类结构适合用于训练和评估疟疾感染检测模型,也可作为细胞图像分类算法在医学场景下的基准数据使用。

【数据集背景】

疟疾是由寄生虫引起的传染病,临床与实验室场景中对感染细胞的识别是相关检测流程的重要环节。随着图像分析与机器学习方法在医学图像领域的应用,构建带有感染/未感染标注的细胞图像数据集,可以为感染检测模型的训练与评估提供数据基础。“Malaria: cell images”正是在这一背景下公开的数据资源,其分类归属为感染/寄生虫病,聚焦于疟疾相关的细胞形态二分类问题。

【数据内容】

该数据集包含2个文件夹,分别为“Parasitized”(寄生感染)与“Uninfected”(未感染),图像总数为27,558张。数据以单个文件形式提供,文件样例为cell_images.zip,下载后为ZIP压缩包格式,合计355.94 MB。数据覆盖感染与未感染两类细胞形态,标签体系为二分类,即每张图像归属于寄生感染或未感染其中之一。

【采集与来源】

数据集来源站为data.mendeley.com(Mendeley Data),发布时间为2022年8月11日,版本为v1,DOI为10.17632/y7z2vg7fmy.1。源站描述说明该数据集包含上述两个文件夹及27,558张图像。关于图像的具体采集地点、采集设备、染色方法、供体信息及伦理审批等细节,源站未提供。

【适用场景】

依据其感染与未感染两类细胞形态的构成,该数据集适用于疟疾相关的细胞图像二分类任务,可用于训练和评估感染检测模型。典型用途包括细胞图像分类模型的开发与对比、感染检测流程中的图像识别环节验证,以及作为医学图像二分类算法在寄生虫病场景下的实验数据。由于标签为二分类结构,其适用范围集中于感染/未感染的判别,不涉及虫种分型或多类别识别。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件cell_images.zip,该压缩包合计355.94 MB,解压后按“Parasitized”与“Uninfected”两个文件夹组织图像。读取时按ZIP压缩包格式处理,建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因路径、命名或编码问题导致批量处理出错。在模型训练中,可将两个文件夹分别作为正负类标签来源,构建二分类训练集与评估集。

【质量与限制】

该数据集提供27,558张图像,规模较大且类别结构清晰,便于二分类任务使用。但源站未提供图像分辨率、采集条件、标注流程与标注一致性等信息,也未说明各类别图像的具体数量分布;此外,数据仅以单一ZIP压缩包形式提供,未提供划分好的训练集、验证集与测试集。使用时应自行核查数据完整性并合理划分数据,相关质量细节以源站说明为准。

【引用与许可】

该数据集的DOI为10.17632/y7z2vg7fmy.1,版本为v1,来源为Mendeley Data。使用时应通过该DOI引用原始数据。关于具体的许可条款与使用限制,源站未提供。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://data.mendeley.com/datasets/y7z2vg7fmy/1

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 355.9 MB。

数据说明

Ghazala HCINI (2022). Malaria: cell images [Dataset]. http://doi.org/10.17632/y7z2vg7fmy.1

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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