宿主-寄生虫共进化数据：寄生虫遗传多样性与水平基因转移

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/null

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集源于一项宿主-寄生虫共进化实验研究，聚焦于线虫Caenorhabditis elegans与其微生物寄生虫Bacillus thuringiensis之间的相互作用。数据内容包括：1）细菌染色体基因标记的遗传多样性数据；2）质粒编码的毒素基因标记数据；3）水平基因转移频率的测量结果。数据通过实验室对照实验与共进化实验对比生成，旨在探究共进化压力如何影响寄生虫的遗传多样性及其获得机制。主要研究方向为宿主-寄生虫协同进化动力学、寄生虫适应性进化机制以及水平基因转移在共进化中的作用，适用于进化生物学、寄生虫学及微生物遗传学研究。

数据加载示例（表格/文本类）

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))