恶性疟原虫无性血液阶段翻译的基因组范围调控动态数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.vb855

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 139.7 MB。

数据说明

对恶性疟原虫转录组和蛋白质组的表征一直是理解该寄生虫分子生理学的巨大资源。然而，连接稳态mRNA与蛋白质水平的翻译动态尚未得到充分理解。在本研究中，我们通过核糖体图谱分析，在恶性疟原虫血液期发育周期的五个阶段测量全基因组翻译，从而弥合这一脱节。我们的研究结果表明，转录和翻译紧密耦合，仅有不到10%的转录组发生明显的翻译控制。受翻译调控的基因主要与裂殖子逸出功能相关。我们系统地定义了mRNA 5′前导序列、3′非翻译区以及反义转录本，并确定了各自的核糖体占据情况，同时证实核糖体在5′前导序列上的积累是一种常见的转录本特征。这项工作代表了迄今为止对这一医学上重要寄生虫基因表达和翻译的最高分辨率和最全面的描绘。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。