P4小鼠全肾多囊肾病RNA测序数据集

数据集获取

源站：https://bridges.monash.edu/articles/dataset/Bam_and_BAI_files/24521446/2

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自出生后第4天（P4）小鼠全肾组织的RNA测序数据，旨在研究多囊肾病（PKD）的分子机制。数据来源于多种基因敲除小鼠模型，包括对照（Cre）、Aurka敲除（AKO）、Inpp5e敲除（IKO）、Pkd1敲除（PKO）以及Inpp5e与Aurka双敲除（dKO-I）、Pkd1与Aurka双敲除（dKO-P）小鼠的肾脏样本。样本通过Hoxb7-cre介导的收集管特异性敲除构建，其中Inpp5e敲除模拟Joubert综合征相关多囊肾病，Pkd1敲除模拟常染色体显性多囊肾病，Aurka敲除无表型，而双敲除模型显示疾病表型缓解。数据以BAM和BAI文件格式提供，适用于基因表达分析、差异表达研究以及多囊肾病的病理机制探索。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。