2017-2020年长春地区H1N1亚型流感病毒遗传进化谱系鉴别荧光定量PCR检测方法的建立数据集
该数据集包含2017-2020年长春地区H1N1亚型流感病毒的基因序列数据,主要涉及文本模态的HA基因序列信息,通过遗传进化分析识别出四个主要谱系,并基于荧光定量PCR方法建立了谱系鉴别技术,适用于流感病毒的分子流行病学研究、疫苗匹配筛选和快速临床诊断等方向,为公共卫生防控提供科学依据。
创建时间2021-10-15
更新时间2021-10-15
资源简介
该数据集专注于H1N1亚型流感病毒,旨在建立一种基于荧光定量PCR的遗传进化谱系鉴别方法。数据集包含从GenBank和GISAID数据库中收集的2,037条分离自中国的H1N1亚型流感病毒HA基因序列,通过遗传进化分析识别出古典猪流感病毒谱系、季节性人流感病毒谱系、禽流感病毒谱系和欧亚类禽猪流感病毒谱系等4个主要谱系。基于此,研究设计了针对各谱系的鉴别引物,构建了阳性标准质粒,优化了PCR反应体系和条件,验证了方法的敏感性和特异性。数据内容涵盖基因序列、引物设计、实验参数和检测结果,适用于流感病毒分子流行病学、疫苗研发和快速诊断技术等研究方向。
提供机构:吉林大学
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