2017-2020年长春地区H1N1亚型流感病毒遗传进化谱系鉴别荧光定量PCR检测方法的建立数据集
该数据集包含2017-2020年长春地区H1N1亚型流感病毒的基因序列数据,主要涉及文本模态的HA基因序列信息,通过遗传进化分析识别出四个主要谱系,并基于荧光定量PCR方法建立了谱系鉴别技术,适用于流感病毒的分子流行病学研究、疫苗匹配筛选和快速临床诊断等方向,为公共卫生防控提供科学依据。
基本信息
资源简介
该数据集专注于H1N1亚型流感病毒,旨在建立一种基于荧光定量PCR的遗传进化谱系鉴别方法。数据集包含从GenBank和GISAID数据库中收集的2,037条分离自中国的H1N1亚型流感病毒HA基因序列,通过遗传进化分析识别出古典猪流感病毒谱系、季节性人流感病毒谱系、禽流感病毒谱系和欧亚类禽猪流感病毒谱系等4个主要谱系。基于此,研究设计了针对各谱系的鉴别引物,构建了阳性标准质粒,优化了PCR反应体系和条件,验证了方法的敏感性和特异性。数据内容涵盖基因序列、引物设计、实验参数和检测结果,适用于流感病毒分子流行病学、疫苗研发和快速诊断技术等研究方向。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后,才能进行数据下载,注册有对应要求,或者需要收费。
暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载,应该可以免费公开下载。
暂未开放有偿下载
Tips: 该数据集 Qianfanghub 可以协助提供有偿下载服务,注意,服务不针对数据相关产权,只是技术服务费。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.agridata.cn/data.html#/datadetail?id=289500
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集专注于H1N1亚型流感病毒,旨在建立一种基于荧光定量PCR的遗传进化谱系鉴别方法。数据集包含从GenBank和GISAID数据库中收集的2,037条分离自中国的H1N1亚型流感病毒HA基因序列,通过遗传进化分析识别出古典猪流感病毒谱系、季节性人流感病毒谱系、禽流感病毒谱系和欧亚类禽猪流感病毒谱系等4个主要谱系。基于此,研究设计了针对各谱系的鉴别引物,构建了阳性标准质粒,优化了PCR反应体系和条件,验证了方法的敏感性和特异性。数据内容涵盖基因序列、引物设计、实验参数和检测结果,适用于流感病毒分子流行病学、疫苗研发和快速诊断技术等研究方向。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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