急性治疗HIV感染者完整与缺陷HIV DNA储存库的快速双相衰减

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A0a843a8243d87f75be36a9b6f855448ce1d6201c939868ec8eb3f6402d313870

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管接受了抗逆转录病毒治疗(ART)，HIV仍持续存在于潜伏感染的细胞中（即HIV储存库），并随时间缓慢衰减。本研究利用来自67名在急性感染期接受治疗的HIV感染者(PLWH)的500余份纵向样本，构建了一个数学模型，以通过外周CD4+ T细胞预测储存库的衰减。非线性广义相加模型显示，完整DNA呈快速双相衰减（第0-5周：t1/2约2.83周；第5-24周：t1/2约15.4周），并延续至1年。这些估计值比既往在慢性期接受治疗的PLWH中所得的衰减估计值快约5倍。缺陷型DNA呈现相似的双相模式，但数据变异性更大。对于ART启动时间更早、初始CD4+ T细胞计数更高以及ART前病毒载量更低的PLWH，预测的完整型和缺陷型衰减速率更快。

在本研究中，我们增进了对ART启动时HIV储存库衰减的有限认识，为未来针对这一关键……的治愈策略提供信息。新诊断的急性HIV感染者（<100天）被纳入UCSF Treat Acute HIV队列，并共同纳入UCSF SCOPE HIV队列，这是一项正在进行的纵向研究，涵盖超过2，500名PWH。符合条件的参与者当天即启动ART，方案为替诺福韦/恩曲他滨（TDF/FTC，2016年TAF/FTC上市后改用TAF/FTC）+多替拉韦（DTG），并转介至临床照护。有伴随PrEP使用史（根据病史和/或临床检测结果，距任何潜在HIV暴露<100天）的个体还加用达芦那韦+利托那韦（DRV/r）作为第四种药物，并持续使用至基线HIV基因型检测结果确认（Monogram Biosciences，南旧金山，加利福尼亚州，美国）。临床照护所需的额外ART调整（如实验室异常、药物相互作用和/或参与者偏好）在研究期间予以尊重并调整。参与者签署了信息发布授权，允许临床数……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。