PRJNA98713：痤疮皮损与正常皮肤基因表达数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA98713

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

痤疮的发病机制与多种因素有关，如皮脂分泌增加、炎症、毛囊角化过度以及毛囊内痤疮丙酸杆菌的作用。为了解炎症性痤疮涉及的具体基因，我们对痤疮患者进行了基因表达谱分析。从6例痤疮患者的炎症性丘疹和正常皮肤获取皮肤活检标本，另从6名无痤疮受试者的正常皮肤获取活检标本。使用Affymetrix HG-U133A 2.0芯片进行基因芯片表达谱分析，比较痤疮患者皮损与非皮损皮肤，并将痤疮患者的非皮损皮肤与正常受试者的皮肤进行比较。在痤疮患者中，皮损皮肤相较于非皮损皮肤有211个基因表达上调。这些基因中相当一部分参与调节炎症和细胞外基质重塑的通路，包括基质金属蛋白酶1和3、IL-8、人β-防御素4和颗粒酶B。这些数据表明基质金属蛋白酶、炎症细胞因子和抗菌肽在痤疮皮损中发挥重要作用。

这些研究首次描述了炎症性痤疮皮损中基因表达的全面变化，对于识别炎症性痤疮的潜在治疗靶点具有重要价值。关键词：痤疮皮损，正常皮肤。总体设计：共18张芯片。6张用于痤疮皮损样本，6张用于正常皮肤样本，6张用于非痤疮患者的正常皮肤样本。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。