PRJNA774989:腹腔内微生物污染通过间皮EGFR信号驱动术后腹膜粘连
该数据集来自NCBI,主题为转录组或基因表达,聚焦腹腔手术后腹膜粘连的形成机制。源站描述显示,肠道微生物污染可增加术后粘连形成,粘连肌成纤维细胞经遗传谱系追踪证实来源于间皮,该转化由EGFR信号驱动,Amphiregulin与Heparin-binding Epidermal Growth Fact

基本信息
资源简介
PRJNA774989:腹腔内微生物污染通过间皮EGFR信号驱动术后腹膜粘连
该数据集来自NCBI,主题为转录组或基因表达,聚焦腹腔手术后腹膜粘连的形成机制。源站描述显示,肠道微生物污染可增加术后粘连形成,粘连肌成纤维细胞经遗传谱系追踪证实来源于间皮,该转化由EGFR信号驱动,Amphiregulin与Heparin-binding Epidermal Growth Factor足以诱导上述变化,抑制EGFR可显著减少小鼠粘连形成,人源粘连组织中富集间皮来源的EGFR阳性细胞。数据可用于研究感染相关术后粘连的分子机制与潜在干预靶点(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):腹部手术是挽救生命的手段,但可能并发腹膜粘连形成,即腹腔内瘢痕,可导致肠梗阻、疼痛、不孕及显著的健康成本。尽管负担沉重,粘连形成的机制仍不清楚,且尚无治愈方法。本研究表明,肠道微生物污染会增加术后粘连形成。利用遗传谱系追踪,我们显示粘连肌成纤维细胞起源于间皮。这一转化由表皮生长因子受体(EGFR)信号驱动。EGFR配体Amphiregulin和Heparin-binding Epidermal Growth Factor足以诱导这些变化。相应地,抑制EGFR可显著减少小鼠粘连形成。从人类患者分离的粘连组织富集间皮来源的EGFR阳性细胞。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:感染性疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA774989
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA774989
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
腹部手术是挽救生命的手段,但可能因腹膜粘连的形成而出现并发症。腹膜粘连是腹腔内瘢痕,可导致肠梗阻、疼痛、不孕以及沉重的医疗费用负担。尽管负担如此之大,粘连形成的潜在机制仍不清楚,且尚无治愈方法。在此,我们表明肠道微生物污染会增加术后粘连形成。利用遗传谱系追踪,我们表明粘连肌成纤维细胞来源于间皮。这一转化由表皮生长因子受体(EGFR)信号驱动。EGFR配体双调蛋白和肝素结合表皮生长因子足以诱导这些变化。相应地,抑制EGFR可显著减少小鼠粘连形成。从人类患者分离的粘连组织中富集了间皮来源的EGFR阳性细胞,并且在细菌性腹膜炎期间,人间皮显示间皮EGFR表达增加。总之,细菌污染通过间皮EGFR信号驱动粘连形成。
该机制可能成为预防腹腔内手术后粘连的治疗靶点。总体设计:C57/Bl6小鼠接受剖腹术并造成腹膜钮扣损伤,伴或不伴盲肠结扎穿刺。术后24小时处死小鼠,并对腹膜钮扣进行处理以进行scRNA测序。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




