PRJNA774989:腹腔内微生物污染通过间皮EGFR信号驱动术后腹膜粘连

该数据集来自NCBI,主题为转录组或基因表达,聚焦腹腔手术后腹膜粘连的形成机制。源站描述显示,肠道微生物污染可增加术后粘连形成,粘连肌成纤维细胞经遗传谱系追踪证实来源于间皮,该转化由EGFR信号驱动,Amphiregulin与Heparin-binding Epidermal Growth Fact

sra
浏览 8
时间序列分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA774989: Intraperitoneal microbial contamination drives post-surgical peritoneal adhesions by mesothelial EGFR-signaling.

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA774989:腹腔内微生物污染通过间皮EGFR信号驱动术后腹膜粘连

该数据集来自NCBI,主题为转录组或基因表达,聚焦腹腔手术后腹膜粘连的形成机制。源站描述显示,肠道微生物污染可增加术后粘连形成,粘连肌成纤维细胞经遗传谱系追踪证实来源于间皮,该转化由EGFR信号驱动,Amphiregulin与Heparin-binding Epidermal Growth Factor足以诱导上述变化,抑制EGFR可显著减少小鼠粘连形成,人源粘连组织中富集间皮来源的EGFR阳性细胞。数据可用于研究感染相关术后粘连的分子机制与潜在干预靶点(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):腹部手术是挽救生命的手段,但可能并发腹膜粘连形成,即腹腔内瘢痕,可导致肠梗阻、疼痛、不孕及显著的健康成本。尽管负担沉重,粘连形成的机制仍不清楚,且尚无治愈方法。本研究表明,肠道微生物污染会增加术后粘连形成。利用遗传谱系追踪,我们显示粘连肌成纤维细胞起源于间皮。这一转化由表皮生长因子受体(EGFR)信号驱动。EGFR配体Amphiregulin和Heparin-binding Epidermal Growth Factor足以诱导这些变化。相应地,抑制EGFR可显著减少小鼠粘连形成。从人类患者分离的粘连组织富集间皮来源的EGFR阳性细胞。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA774989

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA774989

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

腹部手术是挽救生命的手段,但可能因腹膜粘连的形成而出现并发症。腹膜粘连是腹腔内瘢痕,可导致肠梗阻、疼痛、不孕以及沉重的医疗费用负担。尽管负担如此之大,粘连形成的潜在机制仍不清楚,且尚无治愈方法。在此,我们表明肠道微生物污染会增加术后粘连形成。利用遗传谱系追踪,我们表明粘连肌成纤维细胞来源于间皮。这一转化由表皮生长因子受体(EGFR)信号驱动。EGFR配体双调蛋白和肝素结合表皮生长因子足以诱导这些变化。相应地,抑制EGFR可显著减少小鼠粘连形成。从人类患者分离的粘连组织中富集了间皮来源的EGFR阳性细胞,并且在细菌性腹膜炎期间,人间皮显示间皮EGFR表达增加。总之,细菌污染通过间皮EGFR信号驱动粘连形成。

该机制可能成为预防腹腔内手术后粘连的治疗靶点。总体设计:C57/Bl6小鼠接受剖腹术并造成腹膜钮扣损伤,伴或不伴盲肠结扎穿刺。术后24小时处死小鼠,并对腹膜钮扣进行处理以进行scRNA测序。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。