PRJNA297153：儿童川崎病诊断宿主RNA表达验证集HT12V3

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA297153

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对17岁以下患有炎症性疾病、细菌或病毒感染，或具有提示感染临床特征的儿童进行转录谱的全基因组分析。总体设计：患者在就诊时或就诊后于医院招募。主要纳入标准为：年龄小于17岁的儿童，因临床原因需要接受血液检查的疾病严重程度。血液采集于PAX gene管（PreAnalytiX）中。使用Agilent 2100 Bioanalyzer（Agilent，Palo Alto，CA）评估总RNA完整性。将标记的cRNA与Illumina Human HT-12 V3 Beadchips（验证集）杂交。验证集中分析的芯片数量如下：川崎病（n=1）、健康对照（n=16）、明确细菌感染（n=23）、明确病毒感染（n=28）、细菌或病毒病因不确定的感染（n=79）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。