PRJNA108917：13-cis维A酸处理人皮脂腺细胞（SEB-1）
该数据集来自 NCBI，记录人永生化皮脂腺细胞 SEB-1 经 0.1 uM 13-cis 维A酸处理 72 小时或溶剂对照后的基因表达谱，使用 Affymetrix HG-U95Av2 芯片检测
基本信息
资源简介
PRJNA108917：13-cis维A酸处理人皮脂腺细胞（SEB-1）
该数据集来自 NCBI，记录人永生化皮脂腺细胞 SEB-1 经 0.1 uM 13-cis 维A酸处理 72 小时或溶剂对照后的基因表达谱，使用 Affymetrix HG-U95Av2 芯片检测。源站描述指出，13-cis 维A酸是痤疮治疗中最有效的药物，但其作用机制尚不清楚，因此通过表达谱分析寻找皮脂腺细胞特异性机制。数据覆盖受处理影响的基因表达变化，可用于研究痤疮发病机制、维A酸类药物作用通路及皮脂腺细胞转录响应（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：痤疮的发病机制与多种因素有关，例如皮脂分泌增加、炎症、毛囊角化过度以及毛囊内 Propionibacterium acnes 的作用。13-cis 维A酸（13-cis RA，异维A酸）是痤疮治疗中最有效的药物。令人惊讶的是，其在痤疮中的作用机制仍不清楚。为深入了解其皮脂腺细胞特异性作用机制，对经 13-cis RA 处理的培养人永生化皮脂腺细胞（SEB-1）进行了基因表达谱分析。SEB-1 皮脂腺细胞用 0.1 uM 13-cis RA 培养 72 小时或使用溶剂对照。使用 Affymetrix HG-U95Av2 芯片进行基因阵列表达谱分析，以检查处理导致的基因表达变化。共有 85 个基因（78 个不同基因）受到 13-cis RA 的显著影响：58 个上调，27 个下调。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptome or Gene expression。本站分类：感染性疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA108917
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
痤疮的发病机制与多种因素相关，如皮脂分泌增加、炎症、毛囊角化过度以及毛囊内痤疮丙酸杆菌的作用。13-顺式维甲酸（13-cis RA，异维A酸）是痤疮治疗中最有效的药物。令人惊讶的是，其在痤疮中的作用机制仍不清楚。为深入了解其针对皮脂腺细胞的特异性作用机制，研究者对经13-顺式维甲酸处理的人永生化皮脂腺细胞（SEB-1）进行了基因表达谱分析。SEB-1皮脂腺细胞分别以0.1 μM 13-顺式维甲酸或溶剂对照培养72小时。采用Affymetrix HG-U95Av2芯片进行基因阵列表达谱分析，以检测处理引起的基因表达变化。共有85个基因（78个不同基因）受到13-顺式维甲酸的显著影响：58个基因上调，27个基因下调。涉及凋亡和先天免疫的若干基因发生了改变。这些研究首次描述了与异维A酸治疗相关的皮脂腺细胞特异性基因表达反应，对于确定痤疮的潜在治疗靶点具有重要价值。
关键词：72小时13-顺式维甲酸处理对培养的人皮脂腺细胞（SEB-1）的影响 总体设计：共6张芯片：3张溶剂（DMSO）对照和3张13-顺式维甲酸（0.1 μM）处理。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
