PRJNA105993:人皮肤异维A酸治疗前及8周后

该数据集来自 NCBI,收录 8 例接受异维A酸(isotretinoin)治疗的痤疮患者皮肤活检样本,分别在基线及治疗 8 周后取样,使用 Affymetrix HG-U133A 2.0 芯片进行基因表达谱分析

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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA105993: Human Skin: Before and 8 weeks after Isotretinoin Treatment

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA105993:人皮肤异维A酸治疗前及8周后

该数据集来自 NCBI,收录 8 例接受异维A酸(isotretinoin)治疗的痤疮患者皮肤活检样本,分别在基线及治疗 8 周后取样,使用 Affymetrix HG-U133A 2.0 芯片进行基因表达谱分析。源站描述指出治疗后 784 个基因显著变化,其中 197 个上调、587 个下调。数据可用于研究异维A酸治疗痤疮的分子机制及皮肤转录组变化(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):痤疮的发病机制与多种因素有关,如皮脂分泌增加、炎症、毛囊角化过度以及毛囊内 Propionibacterium acnes 的作用。13-顺式维A酸(13-cis RA,异维A酸)是痤疮治疗中最有效的药物。令人惊讶的是,其在痤疮中的作用机制仍不清楚。为深入了解其作用机制,对 8 例接受异维A酸治疗患者的皮肤进行了基因表达谱分析。在基线和异维A酸治疗 8 周时获取患者皮肤活检样本。使用 Affymetrix HG-U133A 2.0 芯片进行基因芯片表达谱分析,以检查治疗导致的基因表达变化。治疗后,784 个基因发生显著变化:197 个上调,587 个下调。8 周时上调的大多数基因

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA105993

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

痤疮的发病机制与多种因素相关,如皮脂分泌增加、炎症、毛囊角化过度以及毛囊内痤疮丙酸杆菌的作用。13-顺式维甲酸(13-cis RA,异维A酸)是治疗痤疮最有效的药物。令人惊讶的是,其在痤疮中的作用机制仍不清楚。为深入了解其作用机制,研究者对8例接受异维A酸治疗患者的皮肤进行了基因表达谱分析。在基线时及异维A酸治疗8周时获取患者皮肤活检标本。采用Affymetrix HG-U133A 2.0芯片进行基因阵列表达谱分析,以检测治疗引起的基因表达变化。治疗后,共有784个基因发生显著变化:197个基因上调,587个基因下调。治疗8周时上调的大多数基因编码细胞外基质结构蛋白,如胶原蛋白、fibulin和纤连蛋白。治疗8周时下调的基因主要参与类固醇、胆固醇和脂肪酸的代谢。

关键词:药物治疗效果 总体设计:共16张芯片:8张基线/异维A酸治疗前和8张异维A酸治疗8周后。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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