物候同步性塑造宿主-寄生虫系统的病理学

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Af58bd06fe3db6386ac54d60c033e0431052c58aaf2100fcd4a56f5016d8e6081

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

围绕当前气候变迁的一个关键挑战，是识别这些变化如何改变物种间的相互作用，包括宿主与寄生虫之间的相互作用。由于传播往往发生在关键的时间窗口内，任一分类单元物候的偏移都可能改变相互作用发生的可能性或由此产生的病理结果。我们量化了两栖类宿主（Pseudacris regilla）易感阶段与致病性吸虫（Ribeiroia ondatrae）感染之间的物候同步性如何决定感染流行率、寄生虫负荷和宿主病理。通过追踪低海拔和高海拔地区（旧金山湾区与南喀斯喀特山脉[拉森山]）宿主和寄生虫感染在整个发育过程中的情况，我们发现，当物候同步性较高时（湾区），相对于同步性较低的地区（拉森山），每个成功建立的寄生虫引起严重肢体畸形的概率高出33%。因此，即使在控制平均感染负荷的情况下，湾区宿主的病理风险仍高出最多50%。

我们的结果表明，宿主-寄生虫相互作用及其导致的病理变化是感染负荷与物候同步性共同作用的产物，这凸显了疾病结果对预测的气候变化的敏感性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。