脑脊液中活性氧快速定量诊断细菌性脑膜炎的多中心测试

该数据集来自 plos.figshare.com,配套 2015 年 PLOS ONE 论文,包含 4 个文件(3 张补充图和 1 份补充表)

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2023-06-04 更新
浏览 7
其他分类meningitirespectively.ConclusionThe ROS testbasal statecsfReactive oxygen speciestbiaucRadical Oxygen SpeciesPMA stimulationcimulticenter cohort 2
Multicenter Testing of the Rapid Quantification of Radical Oxygen Species in Cerebrospinal Fluid to Diagnose Bacterial Meningitis

基本信息

模态
其他
大小
0.003581968 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-04
版本
v1

资源简介

脑脊液中活性氧快速定量诊断细菌性脑膜炎的多中心测试

Multicenter Testing of the Rapid Quantification of Radical Oxygen Species in Cerebrospinal Fluid to Diagnose Bacterial Meningitis

该数据集来自 plos.figshare.com,配套 2015 年 PLOS ONE 论文,包含 4 个文件(3 张补充图和 1 份补充表)。研究针对创伤性脑损伤或神经外科术后发热患者,在脑脊液采样后 4 小时内以发光法测定基础状态及 PMA 细胞刺激后的活性氧水平,用于诊断脑膜炎。数据覆盖单中心训练队列(n=54)和两个教学医院重症与神经外科的多中心测试队列(n=136),并将 ROS 检测与经典脑脊液指标比较,由两名盲法专家做出诊断决策。该数据可用于脑膜炎诊断标志物的分类建模与检测性能评估(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Multicenter Testing of the Rapid Quantification of Radical Oxygen Species in Cerebrospinal Fluid to Diagnose Bacterial Meningitis》发表于 PLOS ONE(2015),DOI:10.1371/journal.pone.0128286。源站首次发布:2015-05-26。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:脑膜炎是创伤性脑损伤(TBI)或神经外科术后需要严重关注的问题。本研究检测发热患者脑脊液(CSF)中活性氧(ROS)的水平,以诊断创伤或手术后数日的脑膜炎。方法:前瞻性纳入TBI或神经外科术后发热患者(体温 > 38°C)。在采样后4小时内,使用发光法在基础状态和用佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯(PMA)刺激细胞后测定CSF中的ROS。研究首先在单中心队列1(n = 54,训练队列)中进行,随后在两个教学医院的重症监护和神经外科部门的多中心队列2(n = 136,测试队列)中进行。将ROS检测的性能与经典CSF标准进行比较,并由两名盲法专家做出脑膜炎的诊断决策。结果:

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 3.58 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0128286。

【主题与分类】

源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:meningiti、respectively.ConclusionThe ROS test、basal state、csf、Reactive oxygen species、tbi、auc、Radical Oxygen Species、PMA stimulation、ci。本站分类:感染性疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biological Sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Multicenter_Testing_of_the_Rapid_Quantification_of_Radical_Oxygen_Species_in_Cerebrospinal_Fluid_to_Diagnose_Bacterial_Meningitis_/1426143

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Lukaszewicz, Anne-Claire; Faivre, Valérie; Bout, Hélène; Gayat, Etienne; Lagergren, Tina; Damoisel, Charles; et al. (2016). Multicenter Testing of the Rapid Quantification of Radical Oxygen Species in Cerebrospinal Fluid to Diagnose Bacterial Meningitis. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-04,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "S2_Fig.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/2082381"
curl -L -o "S3_Fig.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/2082382"
curl -L -o "S1_Table.doc" "https://ndownloader.figshare.com/files/2082383"

文件清单

  • S1_Fig.tif(1.17 MB)
  • S2_Fig.tif(1.17 MB)
  • S3_Fig.tif(1.17 MB)
  • S1_Table.doc(67.07 KB)

文件总体积 3.58 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

目的
脑外伤(TBI)或神经外科手术后,脑膜炎是值得关注的严重问题。本研究检测脑脊液(CSF)中活性氧(ROS)水平,以诊断外伤或手术后数日出现发热患者的脑膜炎。方法
前瞻性纳入TBI或神经外科手术后发热(体温>38°C)患者。采样后4小时内,采用发光法测定CSF中ROS,分别检测基础状态及经佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯(PMA)刺激细胞后的ROS水平。研究首先在单中心队列1(n=54,训练队列)中进行,随后在两所教学医院的ICU和神经外科开展多中心队列2(n=136,验证队列)。将ROS检测的性能与经典CSF指标进行比较,并由两名盲法专家作出脑膜炎诊断决策。结果
脑膜炎患者CSF中ROS的产生高于非感染CSF,无论基础状态还是PMA刺激后均如此。

在队列1中,ROS的产生与脑膜炎的诊断相关,稳态条件下的AUC为0.814(95%置信区间(CI)[0.684–0.820]),PMA激活条件下为0.818(95% CI [0.655–0.821])。在队列1中获得的最佳阈值在队列2中进行了测试,结果显示基础状态下的阴性预测值高、阴性似然比低,分别为0.94和0.36;PMA刺激后分别为0.96和0.24。结论
脑脊液中的ROS检测似乎适用于排除细菌性脑膜炎的诊断。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0128286(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Multicenter_Testing_of_the_Rapid_Quantification_of_Radical_Oxygen_Species_in_Cerebrospinal_Fluid_to_Diagnose_Bacterial_Meningitis_/1426143)。

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