俄亥俄州辛辛那提附近污水中的SARS-CoV-2及目标浓度测量(2020年5月至10月)

该数据集包含2020年5月至10月期间,美国俄亥俄州西南部三个不同下水道流域(Mill Creek WWTP、Taylor Creek WWTP及子流域Lick Run)污水核酸提取物的ddPCR或RT-ddPCR原始液滴计数

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基因组回归Centralized Wastewater Treatment SystemCoronavirus Disease 2019sewershedCOVID-19 SurveillanceddPCRCrAssphagePMMoVhf183Ohio
Measurements of SARS-CoV-2 and target concentrations in wastewater near Cincinnati, OH, from May to October 2020.

基本信息

模态
基因组
任务类型
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创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

俄亥俄州辛辛那提附近污水中的SARS-CoV-2及目标浓度测量(2020年5月至10月)

Measurements of SARS-CoV-2 and target concentrations in wastewater near Cincinnati, OH, from May to October 2020.

该数据集包含2020年5月至10月期间,美国俄亥俄州西南部三个不同下水道流域(Mill Creek WWTP、Taylor Creek WWTP及子流域Lick Run)污水核酸提取物的ddPCR或RT-ddPCR原始液滴计数。检测目标包括SARS-CoV-2核衣壳基因N1和N2、粪便指示物crAssphage、PMMoV、HF183,以及培养冠状病毒RNA加标OC43。在可获取的情况下,还提供pH、流量、温度、TSS、CBOD5等元数据。该数据可用于污水流行病学监测、COVID-19社区传播趋势分析及相关方法学研究(来源 DOI 解析)。

【数据集背景】

源站首次发布:2023。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含来自污水核酸提取物的ddPCR或RT-ddPCR产生的原始液滴计数。污水采集自俄亥俄州西南部的三个不同下水道流域(Mill Creek WWTP、Taylor Creek WWTP以及一个子流域Lick Run)。针对以下目标提供了ddPCR计数(阳性液滴和总液滴):N1和N2(SARS-CoV-2核衣壳基因)、crAssphage、PMMoV、HF183(均为粪便指示物)以及OC43(来自培养冠状病毒的RNA加标)。在可获取的情况下,还提供了其他元数据(pH、流量、温度、TSS、CBOD5)。

【主题与分类】

主题标签:Centralized Wastewater Treatment System、Coronavirus Disease 2019、sewershed、COVID-19 Surveillance、ddPCR、CrAssphage、PMMoV、hf183、Ohio。本站分类:感染性疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://catalog.data.gov/dataset/measurements-of-sars-cov-2-and-target-concentrations-in-wastewater-near-cincinnati-oh-2020

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源站:https://doi.org/10.23719/1522921

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含对废水核酸提取物进行ddPCR或RT-ddPCR所获得的原始微滴计数。废水采集自俄亥俄州西南部的三个不同下水道流域(Mill Creek污水处理厂、Taylor Creek污水处理厂以及一个子流域Lick Run)。针对以下目标提供了ddPCR计数(阳性微滴和总微滴):N1和N2(SARS-CoV-2核衣壳基因)、crAssphage、PMMoV、HF183(均为粪便指示物)以及OC43(来自培养冠状病毒的RNA掺入对照)。在可获得的情况下,还提供了其他元数据(pH、流量、温度、TSS、CBOD5)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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