单独隔离艰难梭菌携带者及作为综合干预措施一部分预防艰难梭菌感染：基于临床研究数据的数学模型
该数据集来自 PLOS ONE 配套研究，包含基于临床研究数据的随机数学模型，用于模拟艰难梭菌在医院的传播。数据覆盖入院时识别并隔离携带者的单策略及综合干预措施对 CDI 发病率和医院获得性定植的影响，基线情景下 CDI 发病率为 6.18/1,000 入院（95% CI，5.72–6.65），携带
基本信息
资源简介
单独隔离艰难梭菌携带者及作为综合干预措施一部分预防艰难梭菌感染：基于临床研究数据的数学模型
Isolation of C. difficile Carriers Alone and as Part of a Bundle Approach for the Prevention of Clostridium difficile Infection (CDI): A Mathematical Model Based on Clinical Study Data
该数据集来自 PLOS ONE 配套研究，包含基于临床研究数据的随机数学模型，用于模拟艰难梭菌在医院的传播。数据覆盖入院时识别并隔离携带者的单策略及综合干预措施对 CDI 发病率和医院获得性定植的影响，基线情景下 CDI 发病率为 6.18/1,000 入院（95% CI，5.72–6.65），携带者获得率为 9.72/1,000 入院（95% CI，9.15–10.31）。可用于评估筛查隔离策略的流行病学效果（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Isolation of C. difficile Carriers Alone and as Part of a Bundle Approach for the Prevention of Clostridium difficile Infection (CDI): A Mathematical Model Based on Clinical Study Data》发表于 PLOS ONE（2016），DOI：10.1371/journal.pone.0156577。源站首次发布：2016-06-03。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：艰难梭菌感染是最常见的医院获得性感染。除感染患者外，携带者已成为艰难梭菌流行病学的关键角色。在本研究中，我们评估了入院时识别并隔离携带者对 CDI 发病率及医院获得性艰难梭菌定植的影响，既作为单一政策，也作为综合干预措施的一部分。我们采用随机数学方法模拟艰难梭菌传播，基于已发表文献考虑携带者的贡献。在基线情景中，CDI 发病率为 6.18/1,000 入院（95% CI，5.72–6.65），模拟了美国医院出院报告中的估计值。艰难梭菌携带的获得率为 9.72/1,000 入院（95% CI，9.15–10.31）。入院时对定植患者进行筛查和隔离降低了 CDI 发病
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 624.98 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0156577。
【主题与分类】
源站学科分类：Space Science、Microbiology、Biotechnology、Chemical Sciences not elsewhere classified、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签：Clinical Study Data Clostridium、RR、admission、antimicrobial stewardship program、CDI incidence、CI、U.S。本站分类：感染性疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Space Science、Microbiology、Biotechnology、Chemical Sciences not elsewhere classified、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Isolation_of_i_C_i_i_difficile_i_Carriers_Alone_and_as_Part_of_a_Bundle_Approach_for_the_Prevention_of_i_Clostridium_difficile_i_Infection_CDI_A_Mathematical_Model_Based_on_Clinical_Study_Data/3417310
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Grigoras, Christos A.; N. Zervou, Fainareti; M. Zacharioudakis, Ioannis; Siettos, Constantinos I.; Mylonakis, Eleftherios (2016). Isolation of C. difficile Carriers Alone and as Part of a Bundle Approach for the Prevention of Clostridium difficile Infection (CDI): A Mathematical Model Based on Clini…
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-02，引用时请注意版本时效。
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Isolation of <i>C</i>. <i>difficile</i> Carriers Alone and as Part of a Bundle Approach for the Prevention of <i>Clostridium difficile</i> Infection (CDI): A Mathematical Model Based on Clinical Study Data
- DOI：10.1371/journal.pone.0156577
- 发布日期：2016-06-03
- 文件数：2 个
- 文件总体积：624.98 KB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Isolation_of_i_C_i_i_difficile_i_Carriers_Alone_and_as_Part_of_a_Bundle_Approach_for_the_Prevention_of_i_Clostridium_difficile_i_Infection_CDI_A_Mathematical_Model_Based_on_Clinical_Study_Data/3417310
命令行下载
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文件清单
S1 File.PDF（254.39 KB）S1 Fig.TIF（370.58 KB）
文件总体积 624.98 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
艰难梭菌感染是最常见的医院获得性感染。除感染患者外，携带者已成为艰难梭菌流行病学中的关键因素。在本研究中，我们评估了入院时识别并隔离携带者对CDI发病率及医院获得性艰难梭菌定植率的影响，分别作为单一策略和作为组合策略的一部分进行评价。我们采用随机数学方法模拟艰难梭菌传播，依据已发表文献考虑携带者的贡献。在基线情景中，CDI发病率为6.18/1,000例入院（95% CI，5.72–6.65），模拟了美国医院出院报告中报告的估计值。艰难梭菌携带状态的获得率为9.72/1,000例入院（95% CI，9.15–10.31）。入院时对定植患者进行筛查和隔离将CDI发病率降至4.99/1,000例入院（95% CI，4.59–5.42；相对降幅（RR）= 19.1%），并使医院获得性定植率降低36.2%。模拟抗菌药物管理项目将CDI率降至2.35/1,000例入院（95% CI，2.07–2.65）。
在敏感性分析中，1000次模拟中有95%的情况下CDI发生率低于2.32/1000例入院（RR=62.4%）。该综合干预措施着重减少定植患者向他人传播艰难梭菌以及这些患者发生CDI的个体风险，显著降低了CDI和医院获得性定植的发生率。将这一综合干预措施应用于当前实践，预计将对遏制CDI产生重要影响。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0156577（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Isolation_of_i_C_i_i_difficile_i_Carriers_Alone_and_as_Part_of_a_Bundle_Approach_for_the_Prevention_of_i_Clostridium_difficile_i_Infection_CDI_A_Mathematical_Model_Based_on_Clinical_Study_Data/3417310）。
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