越南Kobuvirus遗传多样性与跨物种传播数据集

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A7e9867203b2e764077a2b780b077dd67630cce5ecae6f22b36b8ae9c255b2ff6

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

病毒的跨物种传播对公共卫生构成持续威胁。由于人类与其他动物物种之间接触增加，跨物种传播及随之而来的疾病暴发的可能性依然存在。通过常规PCR扩增和下一代测序（NGS），我们从越南一个哨点队列的人群以及包括蝙蝠、啮齿动物、猪、猫和果子狸在内的多种哺乳动物宿主中获得了130个部分或全基因组kobuvirus序列。采用贝叶斯系统发育方法分析了kobuviruses在不同宿主中的进化。我们估计并比较了kobuviruses在不同宿主目中的起源时间；我们还研究了kobuvirus在同一宿主目内以及不同宿主目之间的跨物种传播。我们的数据提供了关于啮齿动物和蝙蝠kobuviruses的新知识，这些病毒与人类kobuviruses亲缘关系最近。从越南南部蝙蝠栖息地分离出的新型蝙蝠kobuviruses在遗传上存在差异……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。