甲酸处理对蜜蜂觅食行为影响的纳米孔宏条形码研究数据集
研究对来自 University of Utah 校园六个蜂箱的蜂花粉样本进行 DNA 宏条形码分析,样本分为甲酸处理组与对照组,并在施药前、施药期间和施药后采集

基本信息
资源简介
甲酸处理对蜜蜂觅食行为影响的纳米孔宏条形码研究数据集
Effect of formic acid treatment on Apis mellifera foraging behavior as assayed using nanopore metabarcoding technologies
该数据集来自 search.dataone.org,围绕甲酸(FA)处理对西方蜜蜂(Apis mellifera)觅食偏好的影响。研究对来自 University of Utah 校园六个蜂箱的蜂花粉样本进行 DNA 宏条形码分析,样本分为甲酸处理组与对照组,并在施药前、施药期间和施药后采集。研究扩增叶绿体 trnL 区域,并使用 Oxford Nanopore Technologies(ONT)便携式测序仪进行实时纳米孔测序,以鉴定花粉植物来源。数据可用于评估 Varroa 螨防治措施对蜜蜂觅食行为的潜在影响,并支持花粉宏条形码与纳米孔测序方法的应用研究(来源 DataONE,Creative Commons Zero v1.0 。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):西方蜜蜂(Apis mellifera)是全球农业和生态健康的重要贡献者,但正经历与 Varroa 螨感染相关的广泛种群下降。甲酸(FA)已越来越多地用于控制 Varroa,但其对 A. mellifera 蜂箱的影响,特别是对其觅食偏好的影响,仍不清楚。在本研究中,我们结合花粉 DNA 宏条形码与实时纳米孔测序,评估 FA 处理如何影响 A. mellifera 的觅食偏好。对来自 University of Utah 校园六个蜂箱的花粉样本进行了 DNA 测序,这些蜂箱分为 FA 处理组和对照组。样本在 FA 施用前、施用期间和施用后采集。我们使用 Oxford Nanopore Technologies(ONT)的便携式测序仪扩增 trnL,这是一个可用于植物鉴定的叶绿体 DNA 区域。
【主题与分类】
主题标签:pollen metabarcoding、Apis mellifera、honeybee foraging behaviors、varroa mite treatment、Oxford Nanopore Technology、DNA metabarcoding、Nanopore sequencing、formic acid treatment。本站分类:感染性疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A90ec2322e5f578f1c952d6cfdf74dd3e0b82b35b788f41f918ce818435d17571
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
西方蜜蜂(Apis mellifera)是全球农业和生态健康的重要贡献者,但其种群正经历与瓦螨感染相关的广泛下降。甲酸(FA)已越来越多地用于控制瓦螨,但其对西方蜜蜂蜂箱的影响,特别是可能对其觅食偏好产生的影响,仍不清楚。在本研究中,我们结合花粉DNA宏条形码技术与实时纳米孔测序,评估了FA处理如何影响西方蜜蜂的觅食偏好。我们对来自犹他大学校园六个蜂箱的花粉样本进行了DNA测序,这些蜂箱被分为FA处理组和对照组。样本在FA施用前、施用期间和施用后采集。我们使用Oxford Nanopore Technologies(ONT)的便携式测序仪扩增了trnL——一个可用于植物鉴定的叶绿体DNA区域。我们检测到,在……处,FA处理蜂箱与对照蜂箱之间的觅食组成存在显著差异。方法 在此,我们利用位于美国犹他州盐湖城犹他大学校园的六个蜂箱,研究了甲酸(FA)处理对西方蜜蜂觅食的影响。
我们利用对采集花粉的宏条形码技术,以了解不同FA处理下的觅食模式。实验设计 蜂箱位置与采样 本研究使用了由犹他大学养蜂人协会维护的六个蜂箱,分别位于两个不同地点:Kahlert大楼附近的四个蜂箱(40.766374, -111.837801)和健康科学教育大楼(HSEB)附近的两个蜂箱(40.769540, -111.834158)。两组蜂箱均被选定为接受FA处理或作为对照。Kahlert蜂箱(以首字母“K”表示)对应2个对照:Km、Kn;2个FA处理:Ke、Ks,而HSEB蜂箱(以首字母“H”表示)对应1个对照:Hm;1个FA处理:Hw。Kahlert与HSEB蜂箱相距0.47公里。花粉采集 花粉采集
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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