免疫功能低下患者感染详情数据集

数据集获取（Figshare）

• 源站标题：Data Sheet 1_Case Report: Beyond conventional diagnostics: mNGS support in a complex immunocompromised patient diagnosis.docx
• DOI：10.3389/fmed.2026.1791094.s001
• 发布日期：2026-05-05
• 文件数：1 个
• 文件总体积：19.29 KB
• 源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Case_Report_Beyond_conventional_diagnostics_mNGS_support_in_a_complex_immunocompromised_patient_diagnosis_docx/32164149

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• Data Sheet 1_Case Report: Beyond conventional diagnostics: mNGS support in a complex immunocompromised patient diagnosis.docx（19.29 KB）

文件总体积 19.29 KB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

下一代宏基因组测序（mNGS）能够直接从临床样本中无偏倚地检测病原体，克服了标准方法的局限性。它在免疫功能低下患者和复杂感染病例中尤其有价值。我们报告一例40多岁、出生于北非的男性患者，因足部轻微外伤后出现进行性皮肤和软组织病变而入院。最初局限性的感染迅速恶化，导致双侧肺炎、急性呼吸衰竭、弥散性血管内凝血和死亡。组织病理学检查显示伴有抗酸杆菌的肉芽肿性炎症，以及一例与噬血细胞综合征相关的未确诊皮肤T细胞淋巴瘤。常规微生物学检测鉴定出多种病原体，包括甲型流感病毒、单纯疱疹病毒1型（HSV-1）、白色念珠菌、粪肠球菌、奇异变形杆菌和铜绿假单胞菌；然而，其分布不均以及从非无菌部位分离的情况妨碍了病因学解释。

尽管组织学检查提示肉芽肿性炎症并可见抗酸杆菌，但分枝杆菌属的培养和分子检测均为阴性。为明确诊断，对血液、血清和淋巴结样本采用宿主DNA去除和Illumina测序进行mNGS检测。生物信息学分析揭示了一个多样化的微生物图谱，检测到假禾谷镰刀菌、卡内蒂分枝杆菌和拉尔斯顿菌属，同时伴有低水平的病毒序列[EB病毒（EBV）和HSV-1]。这些结果反映了患者严重的免疫缺陷，其特征为CD8+ T细胞和NK细胞的显著耗竭。尽管结果获得太晚而未能影响治疗，但mNGS提供了关键的诊断见解，展示了其发现隐藏或罕见病原体的能力。早期应用mNGS可显著提高危重免疫功能低下患者的诊断精确性和治疗决策。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fmed.2026.1791094.s001（source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Case_Report_Beyond_conventional_diagnostics_mNGS_support_in_a_complex_immunocompromised_patient_diagnosis_docx/32164149）。