急性肠系膜缺血时间敏感生物标志物的动物数据系统综述

该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含一份 PDF 文件,对应一项关于小鼠局灶性脑缺血后肠道功能与细菌易位的探索性研究

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2023-06-03 更新
浏览 2
蛋白质bacterial translocationgut-brain axisgut permeabilitygut associated lymphatic tissueimmune systemstroketight junctions
Data from: Potential time-sensitive biomarkers for the detection of acute mesenteric ischaemia: a systematic review of animal data

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.026712698 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-03
版本
v1

资源简介

急性肠系膜缺血时间敏感生物标志物的动物数据系统综述

Data_Sheet_1_Exploratory Investigation of Intestinal Function and Bacterial Translocation After Focal Cerebral Ischemia in the Mouse.pdf

该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含一份 PDF 文件,对应一项关于小鼠局灶性脑缺血后肠道功能与细菌易位的探索性研究。源站描述显示,研究采用 60 分钟大脑中动脉闭塞(MCAO)模型,评估术后多个时间点的肠道形态、紧密连接蛋白(occludin 和 claudin-1)表达,以及肠道通透性、肠相关淋巴组织和细菌易位。数据可用于探讨卒中后脑-肠通讯对肠道功能及细菌易位的影响,并支撑相关生物标志物与机制研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2018-11-19。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景与目的:肠道与大脑通过神经、体液和免疫途径进行双向通讯。所有这些途径均受急性脑损伤(如卒中)影响。因此,脑-肠通讯可能影响中枢神经系统损伤后的整体结局。迄今为止,实验性卒中后肠道功能与肠道细菌易位的报道相互矛盾。据此,我们旨在利用特征明确的小鼠卒中模型开展探索性研究,专门探究短暂性局灶性脑缺血对肠道通透性、肠相关淋巴组织和细菌易位的影响。方法:在大脑中动脉闭塞(MCAO)60 分钟后,我们评估了肠道形态(术后第 0、3、5、14、21 天时间点)和紧密连接蛋白表达(第 1 天和第 3 天的 occludin 和 claudin-1),在 12

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 26.71 MB。数据集 DOI:10.3389/fneur.2018.00937.s001。

【主题与分类】

源站学科分类:Neurology and Neuromuscular Diseases、Neurogenetics。主题标签:bacterial translocation、gut-brain axis、gut permeability、gut associated lymphatic tissue、immune system、stroke、tight junctions。本站分类:感染性疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Neurology and Neuromuscular Diseases、Neurogenetics。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Exploratory_Investigation_of_Intestinal_Function_and_Bacterial_Translocation_After_Focal_Cerebral_Ischemia_in_the_Mouse_pdf/7358972

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Oyama, Naoki; Winek, Katarzyna; Bäcker-Koduah, Priscilla; Zhang, Tian; Dames, Claudia; Werich, Martina; et al. (2018). Data_Sheet_1_Exploratory Investigation of Intestinal Function and Bacterial Translocation After Focal Cerebral Ischemia in the Mouse.pdf. Frontiers. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-03,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Data_Sheet_1_Exploratory Investigation of Intestinal Function and Bacterial Translocation After Focal Cerebral Ischemia in the Mouse.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/13597619"

文件清单

  • Data_Sheet_1_Exploratory Investigation of Intestinal Function and Bacterial Translocation After Focal Cerebral Ischemia in the Mouse.pdf(26.71 MB)

文件总体积 26.71 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

背景与目的:肠道通过神经、体液和免疫途径与大脑进行双向交流。所有这些途径均受到急性脑损伤(如卒中)的影响。因此,脑-肠交流可能影响中枢神经系统损伤后的整体结局。迄今为止,关于实验性卒中后肠道功能及肠道细菌易位的报道相互矛盾。据此,我们旨在采用特征明确的小鼠卒中模型,在一项探索性研究中专门探讨短暂性局灶性脑缺血对肠道通透性、肠道相关淋巴组织及细菌易位的影响。方法:在12周龄雄性C57Bl/6J小鼠中,于大脑中动脉闭塞(MCAO)60分钟后,评估肠道形态学(术后第0、3、5、14、21天时间点)及紧密连接蛋白表达(第1天和第3天的occludin和claudin-1)。于术后24–72小时进行乳果糖/甘露醇/三氯蔗糖试验以评估肠道通透性。

为探究脑缺血对肠道局部免疫系统的影响,我们采用流式细胞术对派尔集合淋巴结(PP)中的主要免疫细胞群进行了定量分析。最后,我们通过微生物培养和针对细菌16S rRNA的荧光原位杂交技术,评估了大脑中动脉闭塞(MCAO)后24小时和72小时细菌向肠外器官的易位情况。结果:短暂性MCAO降低了回肠中claudin-1的表达,但结肠中未见降低。MCAO后,肠道形态(光镜下评估)和通透性均未见可测量的变化。与正常小鼠相比,MCAO后动物PP中的B细胞数量显著减少。结论:在导致大脑中动脉供血区大面积脑梗死的小鼠卒中模型中,我们未发现肠道形态、屏障蛋白和通透性明显改变的证据,也未发现肠道细菌易位的证据。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fneur.2018.00937.s001(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Exploratory_Investigation_of_Intestinal_Function_and_Bacterial_Translocation_After_Focal_Cerebral_Ischemia_in_the_Mouse_pdf/7358972)。

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