低嗜酸性粒细胞及其动态作为感染患者死亡预测因素：队列研究的系统综述与meta分析数据
源站描述聚焦 ridinilazole 与 vancomycin 对粪便微生物群影响的嵌套队列研究，基于 Phase 2 研究参与者，在基线、Day 5、EOT、Day 25、EOS 及 CDI 复发等多个时间点采集粪便，采用 qPCR 和高通量测序评估微生物群变化
基本信息
资源简介
低嗜酸性粒细胞及其动态作为感染患者死亡预测因素：队列研究的系统综述与meta分析数据
Enhanced preservation of the human intestinal microbiota by ridinilazole, a novel Clostridium difficile-targeting antibacterial, compared to vancomycin
该数据集来自 plos.figshare.com，配套论文发表于 PLOS ONE（2018 年），包含 8 个补充文件（tif、docx、pdf 格式）。源站描述聚焦 ridinilazole 与 vancomycin 对粪便微生物群影响的嵌套队列研究，基于 Phase 2 研究参与者，在基线、Day 5、EOT、Day 25、EOS 及 CDI 复发等多个时间点采集粪便，采用 qPCR 和高通量测序评估微生物群变化。数据可用于分析抗菌药物对肠道微生物群的保留作用及 CDI 复发相关微生物特征（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Enhanced preservation of the human intestinal microbiota by ridinilazole, a novel Clostridium difficile-targeting antibacterial, compared to vancomycin》发表于 PLOS ONE（2018），DOI：10.1371/journal.pone.0199810。源站首次发布：2018-08-02。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：Ridinilazole 是一种新型靶向抗菌药物，正在开发用于治疗艰难梭菌感染（CDI）和预防复发。近期一项 Phase 2 研究显示，在主要疗效指标持续临床应答（SCR）方面，ridinilazole 优于 vancomycin，这种优势主要源于 30 天内 CDI 复发率的显著降低。ridinilazole 的耐受性与 vancomycin 相当。本嵌套队列研究比较了 ridinilazole 和 vancomycin 对 Phase 2 研究参与者治疗期间及治疗后粪便微生物群的影响。使用 qPCR 和高通量测序对参与者在多个时间点（基线[Day 1]、Day 5、治疗结束[EOT; Day 10]、Day 25、研究结束[EOS; Day 40]以及 CDI 复发时）采集的粪便进行微生物群变化评估。qPCR
【数据结构与技术规格】
文件数 8 个，合计 1.31 MB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0199810。
【主题与分类】
源站学科分类：Space Science、Cell Biology、Chemical Sciences not elsewhere classified、Ecology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签：vancomycin、EOS、EOT、SCR、leptum group levels、Phase 2 study、ridinilazole、abundance、microbiota、CDI recurrence。本站分类：感染性疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Space Science、Cell Biology、Chemical Sciences not elsewhere classified、Ecology、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Enhanced_preservation_of_the_human_intestinal_microbiota_by_ridinilazole_a_novel_i_Clostridium_difficile_i_-targeting_antibacterial_compared_to_vancomycin/6906272
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Thorpe, Cheleste M.; V. Kane, Anne; Chang, Justin; Tai, Albert; Vickers, Richard J.; R. Snydman, David (2018). Enhanced preservation of the human intestinal microbiota by ridinilazole, a novel Clostridium difficile-targeting antibacterial, compared to vancomycin. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Enhanced preservation of the human intestinal microbiota by ridinilazole, a novel <i>Clostridium difficile</i>-targeting antibacterial, compared to vancomycin
- DOI：10.1371/journal.pone.0199810
- 发布日期：2018-08-02
- 文件数：8 个
- 文件总体积：1.31 MB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Enhanced_preservation_of_the_human_intestinal_microbiota_by_ridinilazole_a_novel_i_Clostridium_difficile_i_-targeting_antibacterial_compared_to_vancomycin/6906272
命令行下载
curl -L -o "pone.0199810.s001.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/12621713"
curl -L -o "pone.0199810.s002.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/12621719"
curl -L -o "pone.0199810.s003.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/12621722"
curl -L -o "pone.0199810.s004.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/12621728"
curl -L -o "pone.0199810.s005.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/12621737"
curl -L -o "pone.0199810.s006.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/12621743"
curl -L -o "pone.0199810.s007.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/12621746"
curl -L -o "pone.0199810.s008.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/12621752"
文件清单
pone.0199810.s001.tif（687.20 KB）pone.0199810.s002.tif（431.54 KB）pone.0199810.s003.docx（15.61 KB）pone.0199810.s004.docx（19.11 KB）pone.0199810.s005.docx（17.01 KB）pone.0199810.s006.pdf（96.00 KB）pone.0199810.s007.docx（18.52 KB）pone.0199810.s008.docx（20.05 KB）
文件总体积 1.31 MB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
Ridinilazole是一种新型靶向抗菌药物，正在开发用于治疗艰难梭菌感染（CDI）及预防复发。近期一项2期研究显示，在主要疗效指标——持续临床应答（SCR）方面，ridinilazole优于万古霉素，其优势主要归因于30天内CDI复发率的显著降低。ridinilazole的耐受性与万古霉素相当。本嵌套队列研究比较了ridinilazole和万古霉素对2期研究参与者治疗期间及治疗后粪便微生物群的影响。通过qPCR和高通量测序对参与者在多个时间点（基线[第1天]、第5天、治疗结束[EOT；第10天]、第25天、研究结束[EOS；第40天]以及CDI复发时）采集的粪便进行微生物群变化评估。qPCR分析显示，万古霉素治疗组在EOT时拟杆菌属、球形梭菌群、柔嫩梭菌群和普雷沃菌属显著减少，而ridinilazole治疗组在EOT时柔嫩梭菌群水平仅轻度下降，至第25天时水平已恢复。
接受万古霉素治疗的参与者中，肠杆菌科细菌显著增加，且这一增加在治疗结束后仍持续存在。在治疗结束时，两种抗生素均导致α多样性下降，但利地尼唑组的下降程度显著较轻（p <0.0001）。β多样性分析显示，万古霉素组从基线至治疗结束的加权Unifrac距离显著更大。在分类学层面，利地尼唑的影响明显更窄，仅使厚壁菌门类群的相对丰度适度降低。利地尼唑组微生物群组成恢复至基线的时间早于万古霉素组。万古霉素治疗导致微生物组广泛变化，厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门的相对丰度显著降低，变形菌门丰度大幅增加。这些结果表明，利地尼唑对微生物群的干扰显著小于万古霉素，这可能有助于解释2期研究中观察到的CDI复发率降低。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0199810（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Enhanced_preservation_of_the_human_intestinal_microbiota_by_ridinilazole_a_novel_i_Clostridium_difficile_i_-targeting_antibacterial_compared_to_vancomycin/6906272）。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
